More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3203 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 272 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 269 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2681  putative oxidoreductase  35.14 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.12 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0978902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.68 
 
 		 277 aa  68.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1056  hypothetical protein  31.25 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.09 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.919217  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2322  hypothetical protein  31.85 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0603  hypothetical protein  31.65 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0156103  normal  0.420839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0620  hypothetical protein  32.28 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.815314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.9 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000526189  normal  0.715416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.35 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  32.59 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  33.81 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1997  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.1 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2000  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.1 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00796111  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  35.4 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.03 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0847  short chain dehydrogenase/reductase family protein  30.7 
 
 		 234 aa  62  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2305  hypothetical protein  29.56 
 
 		 246 aa  62  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.4 
 
 		 238 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  37.17 
 
 		 248 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 		 276 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496279  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0139206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3736  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.37 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.92 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  decreased coverage  0.0061856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  32.14 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 		 265 aa  61.2  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  37.72 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2966  oxidoreductase  37.89 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.959173  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.38 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0281  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  33.8 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  36.84 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3067  acetoacetyl-CoA reductase  31.79 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60014  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1682  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  27.44 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810496  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3784  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0333055  hitchhiker  0.00262398 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15900  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.57 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.166031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3545  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.66 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4032  short chain dehydrogenase  29.28 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.39 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>