More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0771 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
272 aa  524  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.42 
 
 
269 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.74 
 
 
275 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
274 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.18 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.18 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.18 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.03 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.03 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0461211  normal  0.665648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
280 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.7 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.663027  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
200 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
279 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
285 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.93 
 
 
272 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
279 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
279 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
278 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3996  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.16 
 
 
272 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
268 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
271 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  36.26 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2391  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.53 
 
 
272 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0353784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  36.26 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
267 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
255 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
264 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
269 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2106  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.51 
 
 
276 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0295312  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
269 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2119  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.51 
 
 
276 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.07 
 
 
273 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
269 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2165  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.51 
 
 
276 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0646722  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
272 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0670652  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
279 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
267 aa  112  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  33.72 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
268 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  31.23 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0281  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  36.94 
 
 
257 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
267 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
266 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.11 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378923 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  32.59 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 
276 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
265 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 
286 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
272 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0335  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
276 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  34.96 
 
 
262 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
273 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0345  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
276 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
253 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.895675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3394  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 
276 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
265 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
252 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
272 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
254 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  33.46 
 
 
256 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
271 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
272 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419002  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 
244 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.521571  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0324  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
276 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0249  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.87 
 
 
258 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0279472  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  34.2 
 
 
257 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
272 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
272 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  32.83 
 
 
253 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
286 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.25 
 
 
274 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
278 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
252 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566971  normal  0.585219 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
251 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
248 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
253 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  32.09 
 
 
257 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
278 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
273 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1997  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.75 
 
 
259 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2000  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.75 
 
 
259 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
257 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
282 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279693  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
279 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
282 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2285  acetoacetyl-CoA reductase  34.32 
 
 
255 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00853533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>