260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2459 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.92 
 
 		 797 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  45.18 
 
 		 765 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  45.41 
 
 		 808 aa  668    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.65 
 
 		 781 aa  662    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 794 aa  1628    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  45.17 
 
 		 797 aa  665    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.91 
 
 		 782 aa  582  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  42.5 
 
 		 766 aa  581  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  42.08 
 
 		 810 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.84 
 
 		 789 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  42.28 
 
 		 782 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  42.28 
 
 		 803 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  42.41 
 
 		 803 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.83 
 
 		 788 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  42.76 
 
 		 803 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  39.8 
 
 		 790 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  39.9 
 
 		 790 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.89 
 
 		 815 aa  555  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  37.77 
 
 		 815 aa  553  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  37.77 
 
 		 815 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.73 
 
 		 786 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  36.13 
 
 		 842 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  31.55 
 
 		 804 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  34.34 
 
 		 803 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  33.92 
 
 		 984 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  34.65 
 
 		 766 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  34.65 
 
 		 766 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  34.23 
 
 		 766 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  34.1 
 
 		 766 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  34.1 
 
 		 766 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.03 
 
 		 785 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.08 
 
 		 794 aa  363  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.42 
 
 		 816 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.36 
 
 		 748 aa  361  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  33.38 
 
 		 783 aa  349  9e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1268  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.17 
 
 		 849 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0271633  normal  0.105864 
 
 
-
 
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  33.2 
 
 		 786 aa  333  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.91 
 
 		 775 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.41 
 
 		 807 aa  323  9.000000000000001e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  32.41 
 
 		 814 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.46 
 
 		 834 aa  317  4e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.44 
 
 		 790 aa  307  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  28.06 
 
 		 754 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.68 
 
 		 778 aa  227  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  26.42 
 
 		 788 aa  217  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.21 
 
 		 791 aa  213  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  25.9 
 
 		 765 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.54 
 
 		 798 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.17 
 
 		 734 aa  155  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  21.87 
 
 		 834 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.87 
 
 		 778 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.33 
 
 		 778 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.57 
 
 		 778 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.62 
 
 		 837 aa  92.8  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.17 
 
 		 875 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.17 
 
 		 875 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.25 
 
 		 852 aa  91.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  22.8 
 
 		 872 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  23.78 
 
 		 866 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.39 
 
 		 832 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.91 
 
 		 876 aa  84.3  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  23.23 
 
 		 866 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.93 
 
 		 861 aa  82.4  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  22.66 
 
 		 868 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1679  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.44 
 
 		 847 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1455  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.5 
 
 		 841 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2757  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.88 
 
 		 823 aa  80.5  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.24 
 
 		 828 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.12 
 
 		 853 aa  78.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.43 
 
 		 840 aa  78.2  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.79 
 
 		 877 aa  78.2  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  20.75 
 
 		 851 aa  78.2  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.07 
 
 		 901 aa  77  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.06 
 
 		 850 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  22.41 
 
 		 901 aa  76.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3974  putative outer membrane usher protein  21.49 
 
 		 866 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.183336  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6324  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.67 
 
 		 830 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.67 
 
 		 830 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.62 
 
 		 859 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  21.74 
 
 		 809 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.12 
 
 		 844 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  21.74 
 
 		 809 aa  75.5  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  21.74 
 
 		 809 aa  75.5  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  21.83 
 
 		 809 aa  74.7  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4155  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.45 
 
 		 836 aa  75.1  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.3 
 
 		 851 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.16 
 
 		 866 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.52 
 
 		 846 aa  73.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  23.91 
 
 		 836 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.65 
 
 		 863 aa  73.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  23.17 
 
 		 836 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  21.57 
 
 		 809 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  21.65 
 
 		 854 aa  73.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2676  fimbrial usher protein  22.54 
 
 		 823 aa  72.8  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.529958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1531  outer membrane usher protein PsaC precursor  22.54 
 
 		 823 aa  72.8  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00459102  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  21.65 
 
 		 854 aa  72.4  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.46 
 
 		 852 aa  72  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  23.32 
 
 		 883 aa  72  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  22.7 
 
 		 829 aa  72  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.28 
 
 		 883 aa  71.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>