264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0610 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 
798 aa  1605    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  33.72 
 
 
754 aa  379  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.36 
 
 
791 aa  342  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.33 
 
 
778 aa  337  5.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  31.76 
 
 
788 aa  331  4e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  30.2 
 
 
765 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.92 
 
 
775 aa  263  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.66 
 
 
794 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  29.81 
 
 
786 aa  247  6.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.69 
 
 
785 aa  241  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  29.49 
 
 
766 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  29.35 
 
 
803 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  29.21 
 
 
766 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  28.17 
 
 
790 aa  237  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  30.25 
 
 
842 aa  236  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.72 
 
 
834 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  29.07 
 
 
766 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  29.07 
 
 
984 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  28.93 
 
 
766 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  28.93 
 
 
766 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1268  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.12 
 
 
849 aa  232  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0271633  normal  0.105864 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  28.31 
 
 
783 aa  232  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.37 
 
 
789 aa  231  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.17 
 
 
808 aa  228  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  27.87 
 
 
790 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.88 
 
 
807 aa  224  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  29.88 
 
 
814 aa  224  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.36 
 
 
816 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.07 
 
 
788 aa  223  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.03 
 
 
748 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  27.09 
 
 
766 aa  207  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.56 
 
 
782 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.16 
 
 
765 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.78 
 
 
781 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.25 
 
 
797 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  26.68 
 
 
803 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.16 
 
 
797 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  26.68 
 
 
782 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  26.58 
 
 
810 aa  201  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  26.68 
 
 
803 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  26.7 
 
 
803 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  26.71 
 
 
815 aa  198  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.71 
 
 
815 aa  198  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  26.71 
 
 
815 aa  197  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.54 
 
 
794 aa  197  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.59 
 
 
786 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.52 
 
 
790 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  25.95 
 
 
834 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  27.27 
 
 
804 aa  161  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.22 
 
 
778 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.95 
 
 
778 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.6 
 
 
734 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.66 
 
 
778 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  25.78 
 
 
913 aa  127  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  25.97 
 
 
939 aa  126  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  25.94 
 
 
914 aa  126  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  25.62 
 
 
914 aa  125  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  26.87 
 
 
870 aa  122  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.87 
 
 
870 aa  122  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.69 
 
 
901 aa  121  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  24.1 
 
 
901 aa  121  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.52 
 
 
864 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4882  outer membrane fimbrial usher protein  25.81 
 
 
814 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405826 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.32 
 
 
837 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.97 
 
 
857 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.322059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.99 
 
 
831 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.23 
 
 
861 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  23.83 
 
 
836 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.49 
 
 
867 aa  111  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  23.17 
 
 
836 aa  110  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.47 
 
 
840 aa  110  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.4 
 
 
832 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.59 
 
 
837 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  23.61 
 
 
851 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  24.02 
 
 
836 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.73 
 
 
850 aa  105  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.43 
 
 
884 aa  104  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.42 
 
 
852 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2118  fimbrial usher family protein  22.66 
 
 
740 aa  103  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.167309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  22.73 
 
 
844 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.79 
 
 
875 aa  100  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.79 
 
 
875 aa  100  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.56 
 
 
866 aa  99.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.16 
 
 
833 aa  100  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  24.1 
 
 
837 aa  99  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  23.32 
 
 
842 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.33 
 
 
886 aa  97.8  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.21 
 
 
859 aa  98.2  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.54 
 
 
963 aa  97.4  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  26.21 
 
 
872 aa  97.4  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  22.81 
 
 
809 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  22.39 
 
 
809 aa  97.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  22.81 
 
 
809 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  22.81 
 
 
809 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.84 
 
 
856 aa  95.9  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  22.63 
 
 
809 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  22.71 
 
 
848 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.53 
 
 
853 aa  94.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1455  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.09 
 
 
841 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.6 
 
 
852 aa  94.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>