236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0865 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  46.81 
 
 
786 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  90.46 
 
 
766 aa  1360    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  91.24 
 
 
803 aa  1373    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  60.96 
 
 
794 aa  886    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  67.81 
 
 
785 aa  979    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  100 
 
 
842 aa  1668    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  67.85 
 
 
816 aa  977    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  67.16 
 
 
748 aa  995    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  90.46 
 
 
766 aa  1360    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  90.59 
 
 
984 aa  1361    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  91.11 
 
 
766 aa  1370    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  90.85 
 
 
766 aa  1365    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  90.59 
 
 
766 aa  1362    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1268  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  61.5 
 
 
849 aa  940    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0271633  normal  0.105864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.04 
 
 
775 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.27 
 
 
781 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.36 
 
 
808 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  38.43 
 
 
783 aa  412  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.38 
 
 
794 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.52 
 
 
797 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.39 
 
 
797 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  36.76 
 
 
766 aa  392  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.39 
 
 
765 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  35.84 
 
 
790 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  35.7 
 
 
790 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.65 
 
 
834 aa  385  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.43 
 
 
786 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  35.36 
 
 
810 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  35.36 
 
 
803 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  35.23 
 
 
782 aa  379  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  35.23 
 
 
803 aa  379  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.32 
 
 
807 aa  379  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  35.32 
 
 
814 aa  379  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  35.48 
 
 
803 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.73 
 
 
789 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.25 
 
 
788 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.31 
 
 
782 aa  347  8e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  30.49 
 
 
815 aa  343  5.999999999999999e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.62 
 
 
815 aa  343  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  30.49 
 
 
815 aa  342  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  32.27 
 
 
754 aa  337  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.44 
 
 
790 aa  327  7e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.46 
 
 
778 aa  272  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  28.75 
 
 
788 aa  251  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.25 
 
 
798 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.62 
 
 
791 aa  233  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  30.9 
 
 
765 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  31.28 
 
 
804 aa  183  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  25.86 
 
 
834 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.65 
 
 
778 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.21 
 
 
734 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.84 
 
 
778 aa  138  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.34 
 
 
778 aa  135  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.32 
 
 
866 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.61 
 
 
840 aa  86.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.83 
 
 
828 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  22.91 
 
 
809 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.5 
 
 
876 aa  79.7  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.09 
 
 
837 aa  79.7  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  22.91 
 
 
809 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  22.91 
 
 
809 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  22.91 
 
 
809 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1631  putative fimbrial usher protein  25.33 
 
 
855 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2757  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.26 
 
 
823 aa  77.8  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0163  fimbrial usher family protein  25.62 
 
 
789 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  22.74 
 
 
809 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.92 
 
 
875 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.92 
 
 
875 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.19 
 
 
831 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  29.05 
 
 
838 aa  75.1  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  29.05 
 
 
838 aa  75.1  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.05 
 
 
838 aa  75.1  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  29.05 
 
 
838 aa  75.1  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  29.05 
 
 
838 aa  75.1  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  22.35 
 
 
853 aa  74.3  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  23.32 
 
 
865 aa  74.3  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  22.35 
 
 
853 aa  74.3  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  22.35 
 
 
853 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.49 
 
 
838 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  28.49 
 
 
863 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  24.79 
 
 
839 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  22.26 
 
 
853 aa  72.4  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  22.02 
 
 
853 aa  72  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  24.38 
 
 
836 aa  71.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.03 
 
 
853 aa  71.2  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  30.14 
 
 
833 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.37 
 
 
852 aa  71.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.26 
 
 
880 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1531  outer membrane usher protein PsaC precursor  23.09 
 
 
823 aa  70.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00459102  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2676  fimbrial usher protein  23.09 
 
 
823 aa  70.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.529958  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  22.58 
 
 
842 aa  70.1  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.31 
 
 
852 aa  70.1  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  22.41 
 
 
842 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.9 
 
 
829 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2399  fimbrial usher protein  22.16 
 
 
826 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  29.95 
 
 
850 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  22.58 
 
 
842 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.87 
 
 
867 aa  68.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4882  outer membrane fimbrial usher protein  22.84 
 
 
814 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405826 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  30.23 
 
 
836 aa  68.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>