More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0508 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0508  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
637 aa  1271    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00184923 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1356  glycosyl transferase, group 1  51.06 
 
 
609 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1835  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.33 
 
 
550 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0998709  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1720  glycosyl transferase group 1  42.01 
 
 
533 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2589  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
546 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1872  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000487215  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21041  hypothetical protein  28.16 
 
 
552 aa  101  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.331475 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01611  hypothetical protein  28.68 
 
 
472 aa  97.8  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2182  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
332 aa  97.4  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  27.14 
 
 
423 aa  70.1  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
425 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  35.66 
 
 
419 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
410 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
424 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
430 aa  64.3  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  30.43 
 
 
406 aa  64.3  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
421 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 
401 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  36.96 
 
 
404 aa  63.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  28.15 
 
 
400 aa  62  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  31.93 
 
 
378 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
756 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
387 aa  62  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
426 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  31.71 
 
 
404 aa  61.2  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1536  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
380 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.248937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
360 aa  60.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
378 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.27 
 
 
396 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
361 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
371 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
362 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
426 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
422 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
385 aa  59.7  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
397 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
361 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
375 aa  59.7  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.29 
 
 
388 aa  58.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 
416 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
435 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  32.84 
 
 
411 aa  58.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
382 aa  57.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
418 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
402 aa  57.4  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
420 aa  57.4  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
392 aa  57  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.84 
 
 
367 aa  56.6  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  26.47 
 
 
416 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
377 aa  56.6  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
377 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
371 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  23.73 
 
 
391 aa  56.6  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
393 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  28.48 
 
 
426 aa  56.6  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
386 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
398 aa  56.2  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
448 aa  56.2  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 
389 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
367 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
396 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
393 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
810 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
374 aa  56.2  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
422 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  31.15 
 
 
442 aa  55.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  22.51 
 
 
379 aa  55.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  33.99 
 
 
428 aa  55.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 
519 aa  55.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.98 
 
 
384 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.75 
 
 
376 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
362 aa  55.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  48.33 
 
 
448 aa  55.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.04 
 
 
431 aa  55.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  21.68 
 
 
378 aa  55.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
393 aa  55.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
385 aa  55.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
438 aa  54.7  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
378 aa  54.7  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
365 aa  54.7  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
376 aa  54.7  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  31.17 
 
 
417 aa  54.7  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  21.73 
 
 
388 aa  54.7  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
384 aa  54.7  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 
370 aa  54.7  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 
377 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.88 
 
 
371 aa  54.3  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  38.95 
 
 
388 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
414 aa  54.7  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  40.2 
 
 
379 aa  54.3  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  31.94 
 
 
443 aa  54.3  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
371 aa  54.3  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
419 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
394 aa  54.3  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
373 aa  53.9  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 
412 aa  53.9  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
384 aa  53.9  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>