More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1720 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1720  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
533 aa  1073    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1835  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.55 
 
 
550 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0998709  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1356  glycosyl transferase, group 1  44.71 
 
 
609 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0508  glycosyl transferase group 1  41.33 
 
 
637 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00184923 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1872  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
547 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000487215  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2589  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
546 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21041  hypothetical protein  27.22 
 
 
552 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.331475 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01611  hypothetical protein  30.18 
 
 
472 aa  94  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2182  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.67 
 
 
431 aa  69.7  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
413 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
536 aa  63.9  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  32.79 
 
 
428 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  29.77 
 
 
458 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
440 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  31.74 
 
 
443 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
434 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4100  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.1 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564193  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
420 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  23.88 
 
 
358 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
421 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
398 aa  58.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
437 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
437 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  29.28 
 
 
424 aa  57.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
379 aa  58.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
390 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3932  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.1 
 
 
381 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3913  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.1 
 
 
381 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  27.35 
 
 
378 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4039  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.1 
 
 
381 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.94 
 
 
374 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.94 
 
 
374 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
421 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.94 
 
 
374 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
379 aa  57.4  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  44.68 
 
 
775 aa  57.4  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.65 
 
 
935 aa  57.4  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
351 aa  57  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  28.73 
 
 
443 aa  57  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
422 aa  57  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 
407 aa  57  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
419 aa  57  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 
387 aa  56.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  26.91 
 
 
417 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.07 
 
 
374 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
446 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.84 
 
 
388 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3994  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  30.06 
 
 
381 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  25.48 
 
 
434 aa  56.2  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  28.64 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.74 
 
 
375 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
393 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
448 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.67 
 
 
392 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  28.14 
 
 
427 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
458 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.67 
 
 
420 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.67 
 
 
420 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.67 
 
 
392 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  28.17 
 
 
426 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.67 
 
 
420 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.67 
 
 
420 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.67 
 
 
420 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  32.5 
 
 
391 aa  53.9  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29460  Glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
451 aa  54.3  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.565576  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.14 
 
 
385 aa  54.3  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
434 aa  54.3  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2194  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
379 aa  53.9  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0354582  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  46.15 
 
 
401 aa  53.9  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  27.37 
 
 
450 aa  53.5  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
425 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
398 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
391 aa  53.5  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
439 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119517  glycosyl transferase, putative alpha-1,3-mannosyltransferase  25.66 
 
 
480 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
361 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
396 aa  52.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
379 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.95 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22554  mannosyltransferase  30.06 
 
 
419 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  46.55 
 
 
714 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
398 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0414  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
363 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  46.55 
 
 
714 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
369 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
448 aa  52  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
399 aa  52  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 
370 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  36.26 
 
 
380 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
482 aa  51.6  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
365 aa  51.6  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  38.53 
 
 
378 aa  51.6  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
380 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
410 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 
442 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.28 
 
 
384 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>