More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1356 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1356  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
609 aa  1224    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0508  glycosyl transferase group 1  51.06 
 
 
637 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00184923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1835  glycosyl transferase, group 1 family protein  47.54 
 
 
550 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0998709  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1720  glycosyl transferase group 1  44.71 
 
 
533 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2589  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
546 aa  139  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1872  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
547 aa  133  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000487215  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21041  hypothetical protein  26.17 
 
 
552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.331475 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01611  hypothetical protein  30.42 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2182  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
332 aa  100  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.54 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
389 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
416 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
507 aa  66.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
379 aa  65.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
422 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  28.17 
 
 
406 aa  65.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
376 aa  65.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  41.23 
 
 
377 aa  65.1  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
389 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
365 aa  63.9  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  32.45 
 
 
416 aa  63.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
402 aa  63.5  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  29.52 
 
 
400 aa  63.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.8 
 
 
396 aa  63.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
377 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
386 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
413 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  37.04 
 
 
450 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  22.95 
 
 
391 aa  62.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
420 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
393 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  27.17 
 
 
423 aa  61.6  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
439 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
369 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
373 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 
387 aa  61.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
410 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
438 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
423 aa  60.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  30.88 
 
 
417 aa  60.8  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
367 aa  60.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
384 aa  60.5  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.92 
 
 
688 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
417 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  34.27 
 
 
426 aa  60.1  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
370 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 
391 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
415 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  32.12 
 
 
369 aa  59.3  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
439 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 
385 aa  59.3  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
439 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.13 
 
 
462 aa  58.9  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
394 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  28.47 
 
 
404 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  29.51 
 
 
404 aa  58.9  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 
446 aa  58.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
389 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
748 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  28.07 
 
 
404 aa  58.9  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
403 aa  58.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  38.32 
 
 
443 aa  58.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
391 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
398 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  29.69 
 
 
431 aa  58.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
350 aa  58.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
434 aa  58.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
756 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
377 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
385 aa  58.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  34.91 
 
 
428 aa  58.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
391 aa  58.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
412 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
345 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
743 aa  57.4  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.82 
 
 
459 aa  57  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
399 aa  57  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
391 aa  57  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.71 
 
 
388 aa  57  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 
404 aa  57  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  35.26 
 
 
634 aa  57  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  36.26 
 
 
417 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.24 
 
 
383 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 
371 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  36.57 
 
 
377 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
345 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
390 aa  56.6  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  35.09 
 
 
399 aa  57  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  39.58 
 
 
407 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
424 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  32.12 
 
 
398 aa  56.6  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  48 
 
 
376 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
378 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 
419 aa  56.2  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3917  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
380 aa  55.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  37.5 
 
 
378 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
370 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>