More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2589 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2589  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
546 aa  1108    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21041  hypothetical protein  37.79 
 
 
552 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.331475 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1872  glycosyl transferase group 1  39.31 
 
 
547 aa  334  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000487215  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01611  hypothetical protein  33.81 
 
 
472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1356  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
609 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1835  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.22 
 
 
550 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0998709  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0508  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
637 aa  114  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00184923 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1720  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
533 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2182  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.07 
 
 
443 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.1 
 
 
443 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
402 aa  70.1  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.07 
 
 
499 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.07 
 
 
443 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.1 
 
 
443 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.1 
 
 
498 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.07 
 
 
495 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  31.56 
 
 
378 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
415 aa  64.7  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
410 aa  64.7  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
392 aa  64.7  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  30.58 
 
 
406 aa  63.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
405 aa  63.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
437 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
437 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
438 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.71 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 
419 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
390 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
419 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
387 aa  58.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  32.95 
 
 
450 aa  58.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
399 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
372 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.2 
 
 
396 aa  57.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
402 aa  57.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
408 aa  57.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
360 aa  57  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.59 
 
 
371 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0120  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
325 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
381 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
406 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
379 aa  56.2  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 
365 aa  55.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
377 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  29.7 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.41 
 
 
376 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36.61 
 
 
775 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  25.81 
 
 
377 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0960  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
345 aa  54.3  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
421 aa  53.9  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
348 aa  53.9  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.48 
 
 
404 aa  53.5  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
384 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
378 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
386 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  32.1 
 
 
400 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
325 aa  53.5  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
439 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  32.33 
 
 
363 aa  53.5  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
458 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
743 aa  53.5  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
430 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  27.13 
 
 
360 aa  52.8  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  31.79 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
367 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 
446 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
439 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 
438 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
439 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
367 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
402 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
385 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
378 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
435 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.11 
 
 
384 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  22.99 
 
 
380 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
393 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
438 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 
413 aa  52  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.68 
 
 
377 aa  52  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.29 
 
 
382 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
405 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
404 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  32 
 
 
466 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1252  starch synthase  41.33 
 
 
535 aa  51.2  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
417 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  23.87 
 
 
377 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  31.93 
 
 
427 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
384 aa  51.2  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
453 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
372 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  23.87 
 
 
373 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  22.92 
 
 
382 aa  50.8  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
810 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 
424 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 
384 aa  50.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>