193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1872 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1872  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 547 aa  1117    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000487215  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21041  hypothetical protein  42.91 
 
 		 552 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.331475 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2589  glycosyl transferase group 1  39.31 
 
 		 546 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01611  hypothetical protein  33.81 
 
 		 472 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1356  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 609 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1835  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.26 
 
 		 550 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0998709  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1720  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 533 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0508  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 637 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00184923 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2182  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 810 aa  64.3  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 		 414 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  36.25 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 		 422 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  30.18 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 		 443 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 		 443 aa  57  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 		 443 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 		 443 aa  57  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 399 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 434 aa  57  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 438 aa  57  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  25.2 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 		 438 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2441  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.6 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.662083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 384 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  25.91 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 396 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.19 
 
 		 371 aa  54.7  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 		 439 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 		 439 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 		 437 aa  55.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 439 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 440 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 		 437 aa  55.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  21.46 
 
 		 378 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0759  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 364 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4039  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  26.16 
 
 		 381 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 		 408 aa  53.9  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  23.34 
 
 		 423 aa  53.9  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 377 aa  53.9  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3994  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  26.16 
 
 		 381 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  27.86 
 
 		 466 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 655 aa  52.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3913  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  25.58 
 
 		 381 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4100  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  25.58 
 
 		 381 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.45 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 407 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0611  glycosyl transferase, family 1  27.86 
 
 		 440 aa  51.2  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 387 aa  51.6  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 378 aa  51.2  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 402 aa  51.2  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3932  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  25.58 
 
 		 381 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  22.93 
 
 		 378 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 430 aa  50.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 378 aa  50.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 390 aa  50.4  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.92 
 
 		 385 aa  50.4  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.65 
 
 		 373 aa  50.4  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 393 aa  50.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  29.86 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 		 398 aa  50.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  27.21 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 396 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  40.54 
 
 		 775 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 372 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  21.9 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  40.54 
 
 		 378 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 		 419 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 820 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  23.67 
 
 		 383 aa  48.5  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  42.03 
 
 		 378 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 369 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0710  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.67 
 
 		 444 aa  48.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2416  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 		 391 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0844793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 417 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 371 aa  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 743 aa  48.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  43.48 
 
 		 406 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>