71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1479 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  100 
 
 		 203 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  48.44 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  34.88 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  37.78 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.67 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.24 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  33.33 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  28.78 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.24 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  34.68 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.58 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.56 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.89 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.12 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  34.83 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  35.2 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.99 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.27 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.27 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  28.25 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.77 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  29.48 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  29.48 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  28.25 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.55 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.37 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  33.55 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.24 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.89 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.12 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  38.18 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  37.64 
 
 		 260 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.86 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.5 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.16 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.35 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  30.43 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.16 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  35.62 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5628  exopolysaccharide synthesis ExoD  34.57 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  0.038562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  24.86 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.34 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.35 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.72 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.72 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  29.73 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.13 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  24.43 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.882846 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  29.14 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  22.03 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  29.41 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.82 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.47 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.1 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.85 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.85 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  27.68 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.67 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00184  ExoD protein  29.21 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.358269  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.37 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  36.92 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.37 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  27.11 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1715  uncharacterized ABC-type transport system permease component-like protein  26.11 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0682  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.94 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0863  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.24 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0449  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.63 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2731  exopolysaccharide synthesis, ExoD  41.07 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176932  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2866  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.68 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4283  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4900  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.57 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.877879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>