53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00184 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00184  ExoD protein  100 
 
 		 205 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.358269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  60.4 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  31.15 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  31.15 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  30.98 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  31.03 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.55 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.73 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.53 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  31.93 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.44 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.55 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.21 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.67 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.47 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  26.44 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  25.67 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.74 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.12 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.12 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  26.51 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.03 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.98 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  22.58 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.36 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.17 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.52 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.09 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.4 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.4 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.32 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.38 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.11 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  23.72 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.06 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.78 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.12 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.05 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.61 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.38 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.67 
 
 		 260 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.86 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  24.55 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  27.75 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.43 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  23.89 
 
 		 313 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.882846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.29 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  23.57 
 
 		 316 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.18 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  22.86 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1715  uncharacterized ABC-type transport system permease component-like protein  28.48 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  28.24 
 
 		 212 aa  41.2  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>