62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0922 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  100 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  95.36 
 
 		 194 aa  374  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  50.82 
 
 		 200 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  36.76 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  34.41 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  32.78 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  29.47 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  32.22 
 
 		 195 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.22 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0449  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.03 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.73 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.49 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  34.71 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  33.14 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.26 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  28.42 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  28.42 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  30.22 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  30.22 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  25 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  23.08 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.9 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.83 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.49 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  31.52 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  25.27 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.48 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  34.04 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.13 
 
 		 210 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.13 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4900  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.66 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.877879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.82 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.57 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.81 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.85 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  28.12 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.41 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.08 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.15 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.78 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  24.21 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.71 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  24.85 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.68 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.2 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5628  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.75 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  0.038562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.41 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  24.35 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.5 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.55 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.41 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.5 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.5 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3395  exopolysaccharide synthesis, ExoD  45.45 
 
 		 82 aa  48.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.141027  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.1 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.14 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.13 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.6 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  29.17 
 
 		 317 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.7 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0863  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.24 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.27 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>