62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1440 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  100 
 
 		 219 aa  427  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00184  ExoD protein  60.4 
 
 		 205 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.358269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.91 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  33.53 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  33.53 
 
 		 200 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  33.33 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  33.33 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  34.42 
 
 		 212 aa  85.1  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  33.33 
 
 		 200 aa  85.1  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.77 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  28.82 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.78 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.95 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.16 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  27.98 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.75 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  27.47 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  29 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.71 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.32 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.74 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.02 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.68 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.69 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  31.79 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.26 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.95 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  27.69 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.65 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.5 
 
 		 251 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  29.44 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  25.15 
 
 		 198 aa  62  0.000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.26 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.16 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.16 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.57 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.18 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.14 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.21 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.48 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  28.88 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.34 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  28.5 
 
 		 317 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.39 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.77 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  28.22 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.88 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.33 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.03 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.88 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  24.85 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  32.82 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.88 
 
 		 260 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  24.29 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.03 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.23 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2731  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.07 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176932  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  25.64 
 
 		 313 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.882846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5628  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.57 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  0.038562 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  22.81 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.45 
 
 		 195 aa  41.6  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0449  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.5 
 
 		 200 aa  41.6  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>