65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2365 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  100 
 
 
207 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  100 
 
 
207 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  76.35 
 
 
205 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  70.53 
 
 
207 aa  304  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  64.42 
 
 
208 aa  269  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  31.63 
 
 
209 aa  107  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.95 
 
 
209 aa  103  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.02 
 
 
227 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.27 
 
 
203 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  33.33 
 
 
218 aa  101  9e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  37.21 
 
 
200 aa  99  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  37.21 
 
 
200 aa  99  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  35.26 
 
 
200 aa  99  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  31.58 
 
 
218 aa  98.6  6e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  34.68 
 
 
200 aa  95.5  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  33.72 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.13 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.83 
 
 
203 aa  89  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  34.94 
 
 
212 aa  89  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.46 
 
 
210 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  24.62 
 
 
200 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.72 
 
 
220 aa  85.1  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.95 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.34 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  35.59 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.85 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.85 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.61 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.21 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.08 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.26 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  28.82 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  26.74 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.57 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.79 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  34.16 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.13 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.13 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0863  exopolysaccharide synthesis ExoD  33.68 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.03 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.61 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.97 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.97 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5628  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.41 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  0.038562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.09 
 
 
316 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.01 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.05 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.87 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.01 
 
 
260 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.07 
 
 
313 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.882846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  23.63 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  23.98 
 
 
191 aa  54.7  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  27.66 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  27.07 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.07 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0682  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.33 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00184  ExoD protein  26.53 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.358269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.5 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.16 
 
 
194 aa  48.9  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.68 
 
 
192 aa  48.9  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  28.04 
 
 
195 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1715  uncharacterized ABC-type transport system permease component-like protein  27.87 
 
 
177 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.09 
 
 
219 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2866  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.51 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4283  hypothetical protein  34.72 
 
 
142 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171315  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>