61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1758 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  100 
 
 		 260 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  91.92 
 
 		 259 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  70.35 
 
 		 210 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  70.35 
 
 		 210 aa  238  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  71.12 
 
 		 198 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5628  exopolysaccharide synthesis ExoD  77.66 
 
 		 188 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  0.038562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  42.27 
 
 		 200 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  37.38 
 
 		 220 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.31 
 
 		 227 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  36.04 
 
 		 203 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  30.61 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  36.96 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  37.11 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  36.65 
 
 		 251 aa  98.6  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.61 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  30.73 
 
 		 218 aa  95.9  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  29.06 
 
 		 200 aa  92.8  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  29.06 
 
 		 200 aa  92.8  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  37.43 
 
 		 202 aa  92  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  32.53 
 
 		 198 aa  91.3  1e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  28.02 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.58 
 
 		 208 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.65 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.89 
 
 		 191 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.58 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  30.3 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.84 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.83 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  29.41 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.81 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.51 
 
 		 189 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  27.75 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.05 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.71 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.78 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.27 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.27 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.14 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.77 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.47 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.04 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.22 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.14 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.6 
 
 		 201 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.6 
 
 		 201 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  30.18 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  26.06 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.58 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.59 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.72 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0863  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.16 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  25.65 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4283  hypothetical protein  31.71 
 
 		 142 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.37 
 
 		 313 aa  53.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.882846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.15 
 
 		 219 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.91 
 
 		 200 aa  48.9  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0449  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.95 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  31.76 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00184  ExoD protein  29.46 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.358269  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  28.74 
 
 		 195 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  32.26 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>