64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1063 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  100 
 
 		 198 aa  370  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  99.49 
 
 		 210 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  96.46 
 
 		 210 aa  305  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  71.12 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  71.12 
 
 		 260 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5628  exopolysaccharide synthesis ExoD  76.63 
 
 		 188 aa  208  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  0.038562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  37.63 
 
 		 200 aa  144  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  38.02 
 
 		 220 aa  111  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  35.4 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  33.53 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  35.96 
 
 		 227 aa  101  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.75 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  28.87 
 
 		 218 aa  97.8  9e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  34.13 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  27.23 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.78 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  34.73 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.95 
 
 		 209 aa  93.6  1e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  28.22 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.12 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.12 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.74 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  36.94 
 
 		 202 aa  88.2  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.39 
 
 		 219 aa  87.8  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.58 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  32.77 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  32.77 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  36.02 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.09 
 
 		 251 aa  85.9  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  28.73 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  28.73 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.57 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  28.14 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.22 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.25 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.81 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.12 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.95 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  34.67 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.85 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.74 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.81 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.77 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.9 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.89 
 
 		 316 aa  61.6  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.28 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.882846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.83 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.51 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.51 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  26.99 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.48 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0863  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.91 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  30.22 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  28.65 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.91 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.12 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  30 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.81 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4283  hypothetical protein  32.94 
 
 		 142 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  26.59 
 
 		 317 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00184  ExoD protein  29.47 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.358269  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4900  exopolysaccharide synthesis ExoD  25.83 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.877879 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0682  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.65 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1715  uncharacterized ABC-type transport system permease component-like protein  29.41 
 
 		 177 aa  41.6  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>