63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3324 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  100 
 
 		 194 aa  386  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  95.36 
 
 		 194 aa  374  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  50.82 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  35.68 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  34.04 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  34.25 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  29.17 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  31.67 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0449  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.03 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.04 
 
 		 195 aa  99  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.67 
 
 		 195 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  33.93 
 
 		 215 aa  97.8  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.13 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  34.71 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.57 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  28.42 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  28.42 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  30.05 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  30.05 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  25.95 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  23.08 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.38 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  31.52 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.42 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.22 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  32.26 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  24.73 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.13 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.13 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.57 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.82 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.4 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4900  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.37 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.877879 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  28.75 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.81 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.73 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.28 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.46 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  24.12 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.71 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5628  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.97 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  0.038562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.68 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  24.85 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.82 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.89 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.3 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.95 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  24.35 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.89 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.41 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.16 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.16 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3395  exopolysaccharide synthesis, ExoD  45.45 
 
 		 82 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.141027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  29.84 
 
 		 317 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.13 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  23.56 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  27.71 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.2 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.08 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.55 
 
 		 220 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0863  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.36 
 
 		 233 aa  42  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  25 
 
 		 313 aa  41.2  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.882846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>