36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4283 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4283  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  276  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171315  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  60.19 
 
 
227 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  49.24 
 
 
251 aa  120  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  50 
 
 
220 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  57.73 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  50.54 
 
 
219 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  50 
 
 
189 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  35.24 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  35.24 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  30.19 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  41.84 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.08 
 
 
209 aa  67.4  0.00000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  33.62 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  36.54 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  33.91 
 
 
218 aa  63.2  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.31 
 
 
205 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.41 
 
 
231 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  29.03 
 
 
200 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  39.29 
 
 
198 aa  52  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  33.68 
 
 
200 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  29.91 
 
 
200 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.71 
 
 
313 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.882846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33 
 
 
210 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.94 
 
 
198 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  33.33 
 
 
203 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  34.72 
 
 
207 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  34.72 
 
 
207 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.71 
 
 
260 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.89 
 
 
259 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  35.21 
 
 
207 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.62 
 
 
219 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.18 
 
 
205 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.13 
 
 
316 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.74 
 
 
210 aa  40.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.9 
 
 
208 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>