45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1687 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  100 
 
 		 313 aa  627  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.882846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  50.52 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.43 
 
 		 220 aa  106  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  35.6 
 
 		 200 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  35.6 
 
 		 200 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  32.95 
 
 		 200 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.79 
 
 		 227 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  31.77 
 
 		 200 aa  92.8  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.33 
 
 		 205 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  30.94 
 
 		 209 aa  85.1  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.49 
 
 		 209 aa  82  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  31.33 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.61 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  31.35 
 
 		 198 aa  79  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  33.33 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.69 
 
 		 220 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  28.96 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  28.12 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.27 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.33 
 
 		 203 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  24.43 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  27.22 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.86 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.53 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.77 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.11 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.07 
 
 		 207 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.07 
 
 		 207 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.65 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.86 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.18 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.09 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.84 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.57 
 
 		 198 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.72 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4283  hypothetical protein  28.71 
 
 		 142 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  27.72 
 
 		 212 aa  49.3  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.47 
 
 		 191 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.08 
 
 		 198 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.12 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  30 
 
 		 259 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.23 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.67 
 
 		 194 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.79 
 
 		 194 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  23.67 
 
 		 210 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>