59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4288 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  100 
 
 		 210 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  45.54 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  45.99 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  36.73 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.66 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0863  exopolysaccharide synthesis ExoD  35.83 
 
 		 233 aa  97.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.81 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.56 
 
 		 227 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  36.9 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  36.9 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  35.23 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  30.16 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  30.16 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  29.38 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.93 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.65 
 
 		 220 aa  85.1  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.81 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  29.44 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.43 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.6 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  25 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.15 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  28.27 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.96 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  27.27 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  25.39 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  26.06 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  31.01 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.21 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.21 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.12 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2866  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.27 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.7 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.77 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.15 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.61 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.9 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.26 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.74 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  25.7 
 
 		 259 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.74 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  31.58 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.45 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.74 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  23.6 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.81 
 
 		 260 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  24.64 
 
 		 317 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.04 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0449  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2731  exopolysaccharide synthesis, ExoD  40.58 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176932  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  23.7 
 
 		 313 aa  45.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.882846 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  27.75 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1715  uncharacterized ABC-type transport system permease component-like protein  34.29 
 
 		 177 aa  45.1  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  20.97 
 
 		 316 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.57 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5628  exopolysaccharide synthesis ExoD  25.22 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  0.038562 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0682  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.27 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>