67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2501 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  100 
 
 
191 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  44.63 
 
 
191 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  37.04 
 
 
191 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  42.86 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  41.04 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  35.45 
 
 
194 aa  111  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  34.41 
 
 
194 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  38.33 
 
 
200 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.81 
 
 
227 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.18 
 
 
200 aa  91.7  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  34.48 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  30.72 
 
 
218 aa  88.6  5e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  30.12 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0449  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.02 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  28.89 
 
 
209 aa  86.3  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.17 
 
 
203 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.65 
 
 
195 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  28.65 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  30.34 
 
 
200 aa  85.5  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  30.34 
 
 
200 aa  85.5  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  33.15 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.98 
 
 
220 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.88 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.03 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.17 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  30.64 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  26.01 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.95 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.11 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  30 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  25.73 
 
 
200 aa  72  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.07 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.57 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  25.73 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.57 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4900  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.58 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.877879 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  27.06 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  33.33 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  30 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.97 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.33 
 
 
210 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.98 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.33 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.41 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.38 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.92 
 
 
231 aa  61.2  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.57 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.49 
 
 
251 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  28.42 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.41 
 
 
198 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  33.85 
 
 
259 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  34.78 
 
 
260 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.04 
 
 
202 aa  54.7  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  34.65 
 
 
212 aa  54.7  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.96 
 
 
316 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.13 
 
 
223 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  32.59 
 
 
317 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.31 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.93 
 
 
220 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  24.73 
 
 
210 aa  51.2  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5628  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.79 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  0.038562 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1715  uncharacterized ABC-type transport system permease component-like protein  31.21 
 
 
177 aa  48.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2866  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.09 
 
 
223 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00184  ExoD protein  26.72 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.358269  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.67 
 
 
201 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.67 
 
 
201 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.345513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>