47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3669 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  100 
 
 		 192 aa  374  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0449  exopolysaccharide synthesis, ExoD  57.22 
 
 		 200 aa  207  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  43.96 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  47.68 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  34.04 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  34.41 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  38.24 
 
 		 215 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.58 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  31.46 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  32.58 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  36.76 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.76 
 
 		 222 aa  88.6  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.03 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.83 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4900  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.17 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.877879 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  26.23 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  26.23 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.24 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  21.08 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  27.93 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.84 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.93 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  21.94 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.11 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  28.66 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  24.71 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  23.03 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  23.67 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  26.78 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.6 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.37 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.54 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.68 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.68 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  23.27 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.54 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  25.19 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.43 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  23.37 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.82 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.68 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  31.11 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.62 
 
 		 231 aa  42  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  23.3 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.9 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>