53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3868 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 195 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  99.49 
 
 		 195 aa  377  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  85.05 
 
 		 195 aa  309  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.58 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.22 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.67 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  34.66 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  35.29 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.68 
 
 		 222 aa  99  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0449  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.73 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.84 
 
 		 195 aa  98.2  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.18 
 
 		 191 aa  97.8  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  30.06 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  27.27 
 
 		 191 aa  91.3  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  31.46 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  30.17 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.12 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  26.6 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.66 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  27.18 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  27.18 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  25.97 
 
 		 209 aa  74.3  0.0000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  26.06 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.41 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.54 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.34 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.3 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  29.51 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.41 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4900  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.37 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.877879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  28.74 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.88 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.24 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.22 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.46 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  29.52 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.4 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.74 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.58 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.63 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.4 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.54 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.33 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3395  exopolysaccharide synthesis, ExoD  39.24 
 
 		 82 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.141027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  22.6 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.23 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.27 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.09 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  32.04 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  29.44 
 
 		 317 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.37 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>