62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2814 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  100 
 
 
210 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  64.42 
 
 
212 aa  252  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  44.06 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  40.53 
 
 
220 aa  145  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  35.32 
 
 
201 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  35.32 
 
 
201 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.15 
 
 
210 aa  99  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.63 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0863  exopolysaccharide synthesis ExoD  38.15 
 
 
233 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  31.89 
 
 
200 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  31.89 
 
 
200 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  35.03 
 
 
207 aa  85.1  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.89 
 
 
191 aa  84.7  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.8 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.69 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.82 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  30.99 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  30.65 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.6 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.42 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.89 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.89 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2866  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.56 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.61 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.02 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.47 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  25.44 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  27.11 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.44 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.12 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  27.92 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.82 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  24.35 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.24 
 
 
189 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.26 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  23.12 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.28 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.61 
 
 
205 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  31.71 
 
 
198 aa  61.6  0.000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  27.87 
 
 
191 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  31.4 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  31.54 
 
 
192 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.8 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.27 
 
 
198 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.29 
 
 
194 aa  52  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.78 
 
 
195 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  27.78 
 
 
195 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.78 
 
 
206 aa  51.6  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.27 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  28.86 
 
 
317 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.03 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.27 
 
 
210 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.73 
 
 
223 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.23 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.57 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2731  exopolysaccharide synthesis, ExoD  55.26 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176932  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.37 
 
 
195 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  24.76 
 
 
195 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0449  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.32 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  32.53 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.84 
 
 
259 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00184  ExoD protein  27.18 
 
 
205 aa  42  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.358269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>