33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2866 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2866  Exopolysaccharide synthesis ExoD  100 
 
 
223 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.63 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.12 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.45 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  25.53 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.66 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  25.15 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.67 
 
 
198 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  23 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  23 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.15 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1715  uncharacterized ABC-type transport system permease component-like protein  32.76 
 
 
177 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.09 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  27.15 
 
 
200 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.74 
 
 
207 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.74 
 
 
207 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  26.14 
 
 
200 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.59 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.04 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.91 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  25.3 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.08 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.86 
 
 
219 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  24.11 
 
 
218 aa  48.1  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.71 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.81 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.56 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2731  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.2 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176932  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  29.38 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  28.84 
 
 
317 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.87 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0863  exopolysaccharide synthesis ExoD  25 
 
 
233 aa  42.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  24.84 
 
 
198 aa  42  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>