59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2731 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2731  exopolysaccharide synthesis, ExoD  100 
 
 		 214 aa  390  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176932  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  30.67 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  29.75 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  38.22 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  33.85 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  35.5 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  36.18 
 
 		 317 aa  74.7  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.31 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.53 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  30.52 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  30.52 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  38.19 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.96 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.92 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  29.94 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  35.85 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.03 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  37.37 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  37.5 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.05 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  37.5 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.23 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  37.84 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.09 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.7 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.77 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.49 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  39.1 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.64 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  38.38 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2866  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.33 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  25.97 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.13 
 
 		 316 aa  55.1  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  25.97 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  36.59 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.67 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.63 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  28.92 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.95 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.95 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.39 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.67 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.1 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1715  uncharacterized ABC-type transport system permease component-like protein  36.21 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.45 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.45 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  31.25 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.61 
 
 		 313 aa  48.1  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.882846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5628  exopolysaccharide synthesis ExoD  34.94 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  0.038562 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.54 
 
 		 251 aa  48.1  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.58 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  32.54 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.31 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.74 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  36.05 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.24 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0863  exopolysaccharide synthesis ExoD  37.29 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0682  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.48 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>