53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1242 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  58.38 
 
 		 210 aa  235  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  56.12 
 
 		 198 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  34.31 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  36.61 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.53 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.98 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.33 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  28.72 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.02 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  28.72 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.13 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.13 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  33.33 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  28.33 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  29.22 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  34.87 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.54 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.63 
 
 		 220 aa  72  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.33 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.72 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.14 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.84 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  27.07 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.7 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  30.67 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.78 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  32.12 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0863  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.56 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.59 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.08 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  32.7 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  29.21 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00184  ExoD protein  29.12 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.358269  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.81 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.57 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  32.82 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  25 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.45 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.49 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.18 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.33 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.21 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  25.76 
 
 		 317 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.63 
 
 		 316 aa  48.5  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2866  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.14 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.13 
 
 		 259 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.72 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  27.45 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.6 
 
 		 260 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5628  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.37 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  0.038562 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  25.82 
 
 		 191 aa  42  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>