45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1256 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  100 
 
 		 206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0449  exopolysaccharide synthesis, ExoD  42.57 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  43.96 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  39.55 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  39.46 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  34.86 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  34.71 
 
 		 194 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  34.71 
 
 		 194 aa  104  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.66 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  34.66 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  33.66 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  36.42 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.94 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.34 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  26.22 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.89 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  25.15 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  25.15 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4900  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.65 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.877879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.9 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  31.06 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.09 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.2 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  22.16 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.92 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  25.42 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  26.29 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.81 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  25.28 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  23.93 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  19.55 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  20.67 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.63 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.63 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.63 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.28 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.47 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.78 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.57 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.93 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.47 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5628  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.4 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  0.038562 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  23.97 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.42 
 
 		 231 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>