55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4613 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  100 
 
 		 222 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  36.36 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  35.29 
 
 		 194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  40.98 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  38.69 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  29.73 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  41.21 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4900  exopolysaccharide synthesis ExoD  36.63 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.877879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.21 
 
 		 191 aa  99  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  39.46 
 
 		 206 aa  96.3  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  30.68 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.68 
 
 		 195 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0449  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.4 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  30.11 
 
 		 195 aa  88.6  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.76 
 
 		 192 aa  88.2  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  30.65 
 
 		 192 aa  85.1  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  25 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  25 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  32.95 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  28.87 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.59 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.29 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  24.04 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.08 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  22.99 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  28.98 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.37 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  27.37 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  34.72 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  23.81 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.9 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  26.06 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.87 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.06 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.06 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.59 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.67 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.06 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.71 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.78 
 
 		 260 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  24.72 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.31 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.05 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.22 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.46 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.11 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.73 
 
 		 259 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  21.26 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3395  exopolysaccharide synthesis, ExoD  35.37 
 
 		 82 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.141027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  24.03 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  22.75 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.66 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.44 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.99 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>