44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0682 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0682  exopolysaccharide synthesis, ExoD  100 
 
 		 210 aa  414  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.73 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.74 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.74 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.62 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.75 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.57 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.88 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.56 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  26.32 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  25.97 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.37 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.38 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.4 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  23.91 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  23.91 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  24.24 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  27.78 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  32.28 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.17 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.57 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.52 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.3 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  26.7 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  22.63 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  23.37 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  24.61 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  20.61 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  24.75 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  20.5 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.86 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  24.73 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.13 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.13 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  22.62 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  27.69 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.73 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  25.67 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.6 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  27.74 
 
 		 317 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  22.75 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.63 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.49 
 
 		 195 aa  42  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>