278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0759 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0759  putative transcriptional regulator  100 
 
 
176 aa  330  7.000000000000001e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.170248  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2137  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.63 
 
 
173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.04 
 
 
174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  41.18 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  46.39 
 
 
195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.51 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  34.68 
 
 
237 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.72 
 
 
187 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  48.87 
 
 
206 aa  114  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.04 
 
 
196 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  43.37 
 
 
236 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  46.2 
 
 
184 aa  110  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.71 
 
 
273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 
243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.77 
 
 
225 aa  108  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.18 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  44.16 
 
 
352 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  35.29 
 
 
282 aa  108  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  43.79 
 
 
221 aa  107  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  42.24 
 
 
387 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  40.74 
 
 
221 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  41.92 
 
 
352 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  41.61 
 
 
372 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.34 
 
 
228 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  41.57 
 
 
226 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  44.3 
 
 
205 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.61 
 
 
387 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 
210 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  45.73 
 
 
263 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  44.51 
 
 
201 aa  105  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  38.82 
 
 
198 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  39.02 
 
 
247 aa  104  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  40.61 
 
 
195 aa  104  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  33.13 
 
 
198 aa  104  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  39.02 
 
 
254 aa  104  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  40.24 
 
 
222 aa  104  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  38.82 
 
 
198 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.82 
 
 
198 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  38.82 
 
 
198 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.12 
 
 
534 aa  104  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  38.82 
 
 
198 aa  103  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  40.48 
 
 
201 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 
171 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  37.58 
 
 
190 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  43.29 
 
 
224 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  33.13 
 
 
195 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  45.38 
 
 
349 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  38.6 
 
 
304 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  46.22 
 
 
360 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 
196 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  39.39 
 
 
197 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  40 
 
 
214 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  41.98 
 
 
257 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  36.42 
 
 
190 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  36.78 
 
 
206 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  33.13 
 
 
195 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  45.67 
 
 
318 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  41.98 
 
 
255 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  48.21 
 
 
199 aa  101  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  36.31 
 
 
206 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  36.65 
 
 
179 aa  101  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  37.43 
 
 
280 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.43 
 
 
389 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  35.37 
 
 
193 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  35.15 
 
 
190 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  45.76 
 
 
442 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  45.76 
 
 
442 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  35.37 
 
 
193 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  40.96 
 
 
337 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  40.48 
 
 
259 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  45.76 
 
 
442 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  45.76 
 
 
442 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  45.76 
 
 
456 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  45.76 
 
 
455 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  45.38 
 
 
343 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  41.36 
 
 
264 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  45.76 
 
 
458 aa  99.8  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  44.81 
 
 
274 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  45.38 
 
 
340 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  35.8 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.14 
 
 
189 aa  99.4  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  45.38 
 
 
345 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  45.38 
 
 
345 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  46.88 
 
 
210 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  45.76 
 
 
456 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  45.38 
 
 
340 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  44.92 
 
 
394 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  45.38 
 
 
345 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  35.8 
 
 
190 aa  99  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  37.5 
 
 
209 aa  99  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  37.65 
 
 
198 aa  99  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  43.79 
 
 
399 aa  99  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  40.49 
 
 
255 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  38.24 
 
 
198 aa  99  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  47.83 
 
 
171 aa  99  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  47.01 
 
 
202 aa  99  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  40.49 
 
 
256 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  44.07 
 
 
408 aa  98.6  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  37.65 
 
 
198 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>