More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2592 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2592  ABC transporter related  100 
 
 		 212 aa  433  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1762  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0535614  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5737  ABC transporter related  42.03 
 
 		 211 aa  177  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1976  ABC transporter related  41.18 
 
 		 210 aa  167  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.0800392 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0409  ABC transporter related protein  33.68 
 
 		 249 aa  104  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0252  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.14 
 
 		 317 aa  100  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.297756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  31.25 
 
 		 247 aa  98.6  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  34.36 
 
 		 310 aa  97.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  31.16 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  32.63 
 
 		 253 aa  95.5  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  34.18 
 
 		 331 aa  94.7  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1173  ABC transporter related  35.02 
 
 		 239 aa  94.7  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.470964  normal  0.243393 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3164  ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2760  ABC transporter related  34.55 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  31.34 
 
 		 338 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  33.5 
 
 		 315 aa  92.8  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  31.82 
 
 		 249 aa  92.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  33.17 
 
 		 337 aa  91.7  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  30.16 
 
 		 327 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  31.31 
 
 		 338 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  32.49 
 
 		 320 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.5 
 
 		 312 aa  90.5  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 		 316 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  33.5 
 
 		 293 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.37 
 
 		 316 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.77 
 
 		 317 aa  89.7  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  30.89 
 
 		 308 aa  89  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  31.66 
 
 		 337 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  31.79 
 
 		 316 aa  89  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  34.03 
 
 		 289 aa  88.2  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  33 
 
 		 369 aa  88.2  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  31 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5596  ABC transporter related protein  31.78 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.273461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  33.5 
 
 		 317 aa  87.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  30 
 
 		 309 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  28.42 
 
 		 325 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  30 
 
 		 309 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  32.69 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  31 
 
 		 325 aa  86.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  28.5 
 
 		 246 aa  86.7  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  32.65 
 
 		 578 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  30.73 
 
 		 367 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  31.43 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.98 
 
 		 311 aa  86.7  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0830  ABC transporter related protein  26.88 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  32.2 
 
 		 290 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  30.46 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  30.3 
 
 		 338 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  30.3 
 
 		 338 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2589  ABC transporter related  31.16 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2537  ABC transporter related  31.16 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  30.65 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  30.65 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.73 
 
 		 317 aa  85.5  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  32.31 
 
 		 414 aa  85.9  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1805  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.21 
 
 		 307 aa  85.1  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130612  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.96 
 
 		 317 aa  85.1  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1068  ABC transporter related  32.65 
 
 		 281 aa  85.5  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  31.43 
 
 		 232 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  31 
 
 		 243 aa  84.7  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  30.54 
 
 		 341 aa  84.7  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  31.43 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0984  ABC transporter related  30.27 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  30.46 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0826  ABC transporter related protein  33.16 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.422704  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  31.16 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  31.1 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  32.47 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  31 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  31.78 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  29.08 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  31.9 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  26.9 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  30.3 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  33.67 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  30.3 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  25.63 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.3 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  30.35 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  31.28 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2017  ABC transporter related  28.06 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  31.16 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  27.92 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1193  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00148533  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  31.98 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  28.14 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.65 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  29.84 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3071  ABC transporter related protein  28.79 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  31.47 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0168  ABC transporter related  29.38 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  31.96 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1924  ABC transporter related  31.82 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1890  ABC transporter related  31.82 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.670859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>