More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0168 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0168  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  502  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0081  gliding motility protein  50.22 
 
 
235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.450143  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1487  ABC transporter, ATP binding protein  41.1 
 
 
233 aa  190  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0491584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  30.93 
 
 
238 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  34.35 
 
 
301 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  34.21 
 
 
301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  33.62 
 
 
302 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  33.62 
 
 
302 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5208  ABC transporter related protein  29.78 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  36.1 
 
 
308 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  32.57 
 
 
246 aa  111  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  32.56 
 
 
237 aa  111  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.75 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2857  ABC transporter, ATP-binding protein  30.17 
 
 
247 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00741343  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.86 
 
 
333 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  30.4 
 
 
244 aa  109  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  34.36 
 
 
273 aa  109  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0764  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  34.19 
 
 
249 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000201929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  30.71 
 
 
244 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  29.54 
 
 
250 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  31.16 
 
 
369 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  33.17 
 
 
234 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0710  ABC transporter related  32.68 
 
 
239 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  27.12 
 
 
301 aa  106  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3148  ABC transporter related  33.99 
 
 
253 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0680393  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  29.81 
 
 
337 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  32.42 
 
 
240 aa  106  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0385  ABC transporter related  31.56 
 
 
248 aa  106  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  31.75 
 
 
303 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  29.92 
 
 
244 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3468  ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 
253 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000910882  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  30.66 
 
 
279 aa  105  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  32.69 
 
 
253 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  30.3 
 
 
300 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3213  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  33.82 
 
 
253 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3150  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  33.82 
 
 
253 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.962721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  28.99 
 
 
310 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  33.04 
 
 
238 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  28.64 
 
 
244 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  30.14 
 
 
311 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  32.08 
 
 
313 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3447  ABC transporter, ATP-binding protein  33.82 
 
 
253 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0135545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  32.59 
 
 
257 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1404  ABC transporter related  29.22 
 
 
356 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0478366  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  32.51 
 
 
253 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  27.8 
 
 
250 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  31.9 
 
 
313 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  29.95 
 
 
301 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 
313 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1457  ABC transporter related  32.39 
 
 
241 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  29.72 
 
 
244 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  34.16 
 
 
247 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  32.7 
 
 
236 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  29.77 
 
 
315 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3240  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
253 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  29.06 
 
 
275 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3493  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
253 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.644181  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  31.51 
 
 
252 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0676  ABC transporter related  32.71 
 
 
298 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.620401  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1172  ABC transporter related  29.27 
 
 
243 aa  103  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  30.88 
 
 
244 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  30.41 
 
 
244 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.03 
 
 
318 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.139774  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  31.31 
 
 
244 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  31.53 
 
 
243 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  30.73 
 
 
330 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  29.32 
 
 
244 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  29.32 
 
 
244 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0252  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.5 
 
 
317 aa  102  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.297756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  29.53 
 
 
244 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  30.41 
 
 
244 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  29.32 
 
 
244 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  34.47 
 
 
311 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  30 
 
 
335 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  31.28 
 
 
239 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  31.34 
 
 
287 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2631  ABC transporter related  30.19 
 
 
301 aa  102  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  32.24 
 
 
241 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  30.12 
 
 
244 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  28.77 
 
 
259 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  32.69 
 
 
303 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  27.01 
 
 
342 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  30.41 
 
 
244 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1289  ABC transporter related  28.63 
 
 
242 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.077287  hitchhiker  0.00948798 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  31.22 
 
 
315 aa  102  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  26.36 
 
 
254 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.3 
 
 
354 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  31.8 
 
 
241 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 
241 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 
241 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  32.56 
 
 
308 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 
241 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.77 
 
 
369 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  31.8 
 
 
241 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  29.68 
 
 
244 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  26.56 
 
 
252 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3454  ABC transporter, ATP-binding protein  32.37 
 
 
253 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  31.25 
 
 
298 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  30.32 
 
 
372 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>