More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5737 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5737  ABC transporter related  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1762  ABC transporter related protein  49.25 
 
 		 218 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0535614  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1976  ABC transporter related  48.07 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.0800392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2592  ABC transporter related  42.03 
 
 		 212 aa  177  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1559  ABC transporter related  33.18 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  29.11 
 
 		 338 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2399  ABC transporter, ATPase subunit  32.7 
 
 		 299 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.196934  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  31.82 
 
 		 340 aa  102  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0247  ABC transporter related  30.66 
 
 		 299 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.702234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  33.16 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  26.76 
 
 		 338 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  27.01 
 
 		 338 aa  94.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1464  ABC transporter-related protein  32.7 
 
 		 299 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  27.01 
 
 		 338 aa  94.7  9e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  34.9 
 
 		 241 aa  93.2  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  31.16 
 
 		 337 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  31.61 
 
 		 238 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  31.34 
 
 		 322 aa  93.2  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  29.77 
 
 		 339 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  29.69 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  30.7 
 
 		 306 aa  92  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  30.61 
 
 		 339 aa  91.7  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  30.57 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  34.44 
 
 		 303 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2760  ABC transporter related  33.14 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3164  ABC transporter, ATP-binding protein  33.14 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3646  ABC transporter related protein  31.47 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0104951 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.92 
 
 		 312 aa  89.7  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  31.92 
 
 		 301 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  28.32 
 
 		 337 aa  89  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0918  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.33 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0887  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.33 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  30.05 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  31.41 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  31.46 
 
 		 301 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  30.7 
 
 		 299 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1742  ABC transporter-related protein  31.11 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.6629  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 		 304 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.41 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 		 304 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  27.23 
 
 		 337 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 		 309 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30 
 
 		 318 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.139774  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  27.23 
 
 		 337 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  30.73 
 
 		 247 aa  85.5  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  30.69 
 
 		 339 aa  85.5  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 307 aa  85.9  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  33.55 
 
 		 318 aa  85.5  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.08 
 
 		 339 aa  84.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1262  ABC transporter related  30 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000313912  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  29.59 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  31.05 
 
 		 747 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  27.78 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  27.65 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  32.26 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2064  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.23 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  29.59 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  30.41 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  31.67 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1173  ABC transporter related  35.05 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.470964  normal  0.243393 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0053  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.63 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  26.05 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  27.46 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0081  gliding motility protein  32.02 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.450143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  29.03 
 
 		 414 aa  82.8  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  30.35 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  32.43 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0611  ATPase  27.1 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  33.15 
 
 		 308 aa  82  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4762  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  26.92 
 
 		 309 aa  81.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000635501  hitchhiker  0.0000711162 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1188  ABC transporter related protein  27.57 
 
 		 262 aa  81.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000880668 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1924  ABC transporter related  26.84 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717328  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  31.61 
 
 		 298 aa  81.6  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1890  ABC transporter related  26.84 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.670859  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  31.05 
 
 		 310 aa  81.3  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  26.51 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  32.57 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  27.6 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.16 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  32.57 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1372  ABC transporter, ATP-binding protein  27.37 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00133001  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  29.94 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  27.37 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  32.32 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  30.56 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  29.32 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  29.76 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1566  ABC transporter related  31 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343962  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  28.5 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  30.28 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  28.93 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1805  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.5 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130612  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.88 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  31.41 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  29.77 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  29.33 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  26.64 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  29.32 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>