More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1976 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1976  ABC transporter related  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.0800392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5737  ABC transporter related  48.07 
 
 		 211 aa  184  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1762  ABC transporter related protein  43.16 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0535614  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2592  ABC transporter related  41.18 
 
 		 212 aa  167  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  32.81 
 
 		 303 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  34.9 
 
 		 303 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0252  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.64 
 
 		 317 aa  98.6  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.297756 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.84 
 
 		 317 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.91 
 
 		 316 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  32.57 
 
 		 318 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  32.62 
 
 		 306 aa  95.5  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  27.89 
 
 		 297 aa  94  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  34.02 
 
 		 338 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  30.73 
 
 		 337 aa  93.6  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0409  ABC transporter related protein  27.81 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  33.33 
 
 		 310 aa  92.8  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  33.33 
 
 		 310 aa  92.8  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  32.45 
 
 		 327 aa  92.4  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  32.99 
 
 		 259 aa  92.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1559  ABC transporter related  31.75 
 
 		 299 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0776966  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  29.32 
 
 		 338 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  31.91 
 
 		 322 aa  92  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.8 
 
 		 317 aa  91.7  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  29.84 
 
 		 338 aa  91.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  33.86 
 
 		 314 aa  91.7  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  29.32 
 
 		 338 aa  91.7  8e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  32.45 
 
 		 313 aa  91.3  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  29.32 
 
 		 338 aa  91.3  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  31.55 
 
 		 370 aa  90.9  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.63 
 
 		 316 aa  90.9  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  27.08 
 
 		 297 aa  90.5  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31 
 
 		 387 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  32.98 
 
 		 318 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  33.68 
 
 		 301 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  32.98 
 
 		 318 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1111  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 384 aa  89.7  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  30.96 
 
 		 325 aa  89.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2399  ABC transporter, ATPase subunit  31.22 
 
 		 299 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.196934  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1284  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  32.84 
 
 		 426 aa  89.7  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.27 
 
 		 317 aa  89.7  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  30.67 
 
 		 275 aa  89  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  30.1 
 
 		 318 aa  89  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  30.32 
 
 		 308 aa  89  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  33.52 
 
 		 305 aa  89  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0191  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase component  32.34 
 
 		 368 aa  88.6  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  31.72 
 
 		 310 aa  88.2  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.27 
 
 		 333 aa  87.8  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1560  ABC transporter related  32.93 
 
 		 344 aa  88.2  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0503147  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  29.81 
 
 		 350 aa  87.4  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.74 
 
 		 334 aa  87.8  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.09 
 
 		 372 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  28.42 
 
 		 304 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0630  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  32.84 
 
 		 372 aa  87.4  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000125028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4762  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.38 
 
 		 309 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000635501  hitchhiker  0.0000711162 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  26.89 
 
 		 337 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  29.69 
 
 		 340 aa  86.7  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  30.53 
 
 		 301 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1464  ABC transporter-related protein  31.75 
 
 		 299 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.02 
 
 		 363 aa  86.3  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.13 
 
 		 367 aa  86.3  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  32.62 
 
 		 301 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  29.69 
 
 		 299 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.12 
 
 		 377 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4445  ABC transporter related  31.41 
 
 		 313 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  31.63 
 
 		 257 aa  85.9  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0611  ATPase  29.63 
 
 		 337 aa  85.9  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  34.55 
 
 		 876 aa  85.9  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  32.45 
 
 		 316 aa  85.5  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  32.49 
 
 		 252 aa  85.5  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0521  ABC transporter related  30.89 
 
 		 301 aa  85.5  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.342097  normal  0.0263898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 304 aa  85.1  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  30.3 
 
 		 304 aa  85.1  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  30.57 
 
 		 244 aa  85.1  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  33.16 
 
 		 301 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  31.09 
 
 		 247 aa  85.1  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  32.07 
 
 		 339 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1145  ABC transporter related protein  28.43 
 
 		 287 aa  84.7  8e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  32.07 
 
 		 339 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2323  ABC transporter related  30.96 
 
 		 307 aa  84.7  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  28.21 
 
 		 316 aa  84.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1751  ABC transporter related  30.48 
 
 		 302 aa  84.7  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1496  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  30.39 
 
 		 384 aa  84.7  9e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.93 
 
 		 312 aa  84.7  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0247  ABC transporter related  29.63 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.702234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0683  ABC transporter related  29.9 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  30.05 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  29.81 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1805  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.08 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130612  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  32.63 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  30.96 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  29.47 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  28.92 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.66 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  32.98 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  31.75 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  29.47 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  30.73 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2589  ABC transporter related  30.48 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>