More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1762 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1762  ABC transporter related protein  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0535614  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5737  ABC transporter related  49.25 
 
 		 211 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2592  ABC transporter related  44.29 
 
 		 212 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1976  ABC transporter related  43.16 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.0800392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3646  ABC transporter related protein  29.72 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0104951 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0252  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.57 
 
 		 317 aa  93.2  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.297756 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.57 
 
 		 411 aa  92.8  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0578  ABC transporter related  28.7 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  31.44 
 
 		 310 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  31.09 
 
 		 414 aa  89.4  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0797  ABC transporter, ATP-binding protein  28.21 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00354056  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1447  ABC transporter related  29.1 
 
 		 367 aa  89  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1751  ABC transporter related  30.22 
 
 		 302 aa  88.6  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1525  ABC transporter related  28.57 
 
 		 367 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.571493  hitchhiker  0.00153278 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2323  ABC transporter related  31.22 
 
 		 307 aa  86.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0387  ABC transporter related  28.57 
 
 		 367 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  26.98 
 
 		 297 aa  86.3  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  30.21 
 
 		 316 aa  86.3  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.68 
 
 		 360 aa  86.3  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  30.73 
 
 		 331 aa  86.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3977  ABC transporter related  32.02 
 
 		 315 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0918  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.93 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0887  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.93 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  31.22 
 
 		 310 aa  85.5  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  29.79 
 
 		 310 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  31.68 
 
 		 241 aa  85.1  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  34.21 
 
 		 305 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  33.33 
 
 		 249 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1496  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  29.9 
 
 		 384 aa  85.1  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0683  ABC transporter related  30.81 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4107  ABC transporter related protein  31.68 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  31.25 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  30.16 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  30.37 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  32.5 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  27.41 
 
 		 317 aa  82  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  31.31 
 
 		 316 aa  82  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  27.23 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0168  ABC transporter related  28.49 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  30.97 
 
 		 322 aa  82  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.02 
 
 		 323 aa  82  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 		 306 aa  81.3  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  28.04 
 
 		 304 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  29.38 
 
 		 327 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  28.79 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1559  ABC transporter related  32.24 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0776966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  28.57 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  32.99 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1616  ABC transporter related  27.1 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  29.32 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  30.1 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  32.49 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  32.98 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0722  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  25.4 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.528459  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  26.8 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  30.11 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.19 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  31.38 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4755  ABC transporter, ATP-binding protein  26.4 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  32.91 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1165  ABC transporter related protein  27.7 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  31.41 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  32.11 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  30.89 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  31.87 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  29.53 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  30.57 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.66 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  32.08 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3171  ABC transporter related  28.72 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1375  ABC transporter related  29.29 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2399  ABC transporter, ATPase subunit  32.79 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.196934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.48 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  29.23 
 
 		 338 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1173  ABC transporter related  33.33 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.470964  normal  0.243393 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.38 
 
 		 326 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  32.3 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  33.33 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3243  ABC transporter related  27.69 
 
 		 368 aa  79  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.08 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  29.59 
 
 		 426 aa  79  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  29.79 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  32.5 
 
 		 332 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2238  ABC transporter related  33.54 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0769136  normal  0.0562594 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  27.51 
 
 		 339 aa  78.6  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 322 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  29.53 
 
 		 337 aa  78.2  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.73 
 
 		 312 aa  78.2  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  32.3 
 
 		 260 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3948  ABC transporter related  31.75 
 
 		 294 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0409  ABC transporter related protein  25.67 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  32.81 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  26.73 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  31.58 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf625  ABC transporter ATP-binding protein  27.08 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  31.77 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0061  ABC transporter related  33.12 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  33.33 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>