More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5596 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5596  ABC transporter related protein  100 
 
 
232 aa  474  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.273461  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0751  ABC transporter related protein  38.16 
 
 
251 aa  135  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  37.56 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  37.5 
 
 
334 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  37.39 
 
 
300 aa  128  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  34.93 
 
 
304 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0007  ABC transporter related  36.04 
 
 
435 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 
306 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 
306 aa  126  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  39.22 
 
 
300 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  34.74 
 
 
306 aa  125  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  33.04 
 
 
238 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  34.12 
 
 
303 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  37 
 
 
325 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  34.12 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  34.62 
 
 
305 aa  123  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  34.12 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  35.68 
 
 
309 aa  123  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  37.39 
 
 
309 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  37.78 
 
 
319 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.65 
 
 
331 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  35.75 
 
 
301 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  33.65 
 
 
303 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  33.65 
 
 
303 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.65 
 
 
331 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  33.65 
 
 
331 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  33.49 
 
 
306 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.58 
 
 
309 aa  122  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  30.62 
 
 
307 aa  121  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  36.45 
 
 
315 aa  121  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  39.72 
 
 
301 aa  121  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.51 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  33.18 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  30.62 
 
 
307 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  33.49 
 
 
297 aa  118  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.82 
 
 
299 aa  118  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.23 
 
 
316 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  36.06 
 
 
302 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  34.12 
 
 
282 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.26 
 
 
313 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  38.42 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  33.18 
 
 
308 aa  116  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  32.87 
 
 
318 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  35.81 
 
 
309 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  34.4 
 
 
305 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
398 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  33.01 
 
 
304 aa  115  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.18 
 
 
317 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  34.11 
 
 
316 aa  115  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  36.02 
 
 
326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0435  ABC transporter related  34.76 
 
 
245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.46 
 
 
317 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  33.98 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  29.58 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  37.31 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  29.58 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.06 
 
 
324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  29.58 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.05 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  33.5 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4316  ABC transporter related protein  34.7 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  32.11 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  35.75 
 
 
308 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  33.18 
 
 
318 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  34.68 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  34.68 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  35.98 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  34.68 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 
309 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 
309 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  29.58 
 
 
300 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 
309 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 
309 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1145  ABC transporter related protein  33.02 
 
 
287 aa  113  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  32.7 
 
 
302 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  35.23 
 
 
307 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  37.04 
 
 
343 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  35.41 
 
 
305 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  35.15 
 
 
303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  34.93 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  32.03 
 
 
241 aa  112  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  31.65 
 
 
241 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0435  ABC transporter related  35.58 
 
 
328 aa  112  5e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.490211  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.88 
 
 
318 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  37.93 
 
 
319 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  32.38 
 
 
305 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  29.86 
 
 
316 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
302 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4281  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.27 
 
 
307 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  30.8 
 
 
651 aa  112  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  31.16 
 
 
237 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  35.65 
 
 
326 aa  112  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>