129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1411 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1411  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 281 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2092  cyclic nucleotide-binding protein  38.46 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.052922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 221 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.607183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.64 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 232 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2554  cyclic nucleotide-binding protein  23.32 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531309  normal  0.0738389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.32 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1200  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0841805  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 225 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 		 348 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.71 
 
 		 227 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  23.64 
 
 		 212 aa  52.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.14 
 
 		 225 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.26 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  25.39 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.3 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  22.81 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  22.81 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  22.81 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  22.81 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  22.81 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.29 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  22.81 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  22.81 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  22.89 
 
 		 210 aa  50.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  22.81 
 
 		 211 aa  49.7  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.67 
 
 		 228 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  22.22 
 
 		 211 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  22.22 
 
 		 211 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  22.22 
 
 		 211 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  22.22 
 
 		 211 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  22.22 
 
 		 211 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.16 
 
 		 227 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.04 
 
 		 228 aa  48.9  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.59 
 
 		 236 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.01 
 
 		 225 aa  49.3  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.16 
 
 		 226 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.04 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  23.03 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  22.22 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  22.29 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 218 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  23.03 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.89 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  21.21 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  22.29 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  22.22 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  22.22 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3715  cAMP-regulatory protein  27.53 
 
 		 229 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.088887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.32 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.79 
 
 		 223 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  21.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  21.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0884  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 214 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  21.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 		 226 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.73 
 
 		 225 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5204  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.26828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.47 
 
 		 236 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  23.78 
 
 		 225 aa  46.2  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 240 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 226 aa  45.8  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 230 aa  45.8  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  24.75 
 
 		 239 aa  45.8  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0733  cyclic nucleotide-binding protein  19.9 
 
 		 232 aa  45.4  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  20.61 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.23 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  22.42 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.27 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0291  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  21.08 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  18.52 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.23 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.42 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  25.15 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.63 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>