296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1168 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1168  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 194 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.703043  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1083  TPR repeat-containing protein  59.41 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.858271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0624  TPR repeat-containing protein  54.59 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.45 
 
 		 357 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.72 
 
 		 406 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.72 
 
 		 406 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  35 
 
 		 581 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  38.18 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.71 
 
 		 746 aa  72.8  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  31.91 
 
 		 306 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.07 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  31.36 
 
 		 462 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 361 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.83 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  36.94 
 
 		 706 aa  68.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  33.94 
 
 		 706 aa  68.2  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  34.45 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 1421 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 617 aa  65.5  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 649 aa  65.1  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.21 
 
 		 308 aa  64.7  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.23 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0096  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00110052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.36 
 
 		 738 aa  62.4  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  33.33 
 
 		 582 aa  62  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 376 aa  62  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 425 aa  62  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 422 aa  61.6  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 306 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.86 
 
 		 1022 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 1827 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  27.42 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 1276 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0131  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1142  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  33.03 
 
 		 750 aa  59.7  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  27.48 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  27.48 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 1192 aa  59.3  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.63 
 
 		 818 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  32.03 
 
 		 539 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 392 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 593 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 306 aa  57.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0110  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563747 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.55 
 
 		 219 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.95 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 428 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.66 
 
 		 784 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  21.97 
 
 		 314 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.36 
 
 		 988 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 547 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2558  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.41 
 
 		 458 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 391 aa  55.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2211  tetratricopeptide domain-containing protein  27.17 
 
 		 425 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 699 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 3145 aa  55.1  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 389 aa  55.1  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 		 471 aa  55.1  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  35.44 
 
 		 929 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 452 aa  54.7  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.11 
 
 		 1056 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 556 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 927 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 499 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 605 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 512 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.84 
 
 		 739 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.62 
 
 		 542 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.82 
 
 		 1694 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 3560 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 356 aa  54.3  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  31.43 
 
 		 164 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 762 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>