More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3720 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3720  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.245172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  57 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  56.22 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.51 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.82 
 
 		 231 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.16 
 
 		 232 aa  209  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.68 
 
 		 224 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.89 
 
 		 226 aa  204  7e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.43 
 
 		 221 aa  204  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.2 
 
 		 214 aa  203  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.98 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.2 
 
 		 214 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.2 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.36 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.2 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.2 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.2 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.2 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2328  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.377828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.2 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.2 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.88 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.2 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.73 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.66 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.72 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.02 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0415  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0446  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0449  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.402606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.07 
 
 		 221 aa  201  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0751  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.86 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07910  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.86 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  55 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.31 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  54.46 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.85 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  51.61 
 
 		 265 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.67 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0163  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.56 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2230  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.98 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.375841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.86 
 
 		 224 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4787  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.07 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.750334 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2582  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.5 
 
 		 230 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1509  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.21 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2879  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.74 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2472  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.74 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2364  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.52 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.07 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.26 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.91 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.74 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 		 224 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.86 
 
 		 225 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.64 
 
 		 236 aa  194  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0307  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.38 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.86 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.85 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.04 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.9 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.09 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.09 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3888  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.85 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.9 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.28 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.09 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.4 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3121  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.3 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.798582  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.17 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.63 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.13 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.64 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.7 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2879  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.75 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.403873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.64 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.45 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.4 
 
 		 223 aa  191  6e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.85 
 
 		 223 aa  191  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.37 
 
 		 264 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.52 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5120  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.92 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2756  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.85 
 
 		 241 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.65 
 
 		 227 aa  191  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>