146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1689 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 412 aa  796    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  35.34 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  32.17 
 
 		 404 aa  196  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.35 
 
 		 577 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  33.91 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1412  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.06 
 
 		 574 aa  169  7e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1539  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0928193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0091  sodium/hydrogen exchanger  33.87 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  29.84 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4297  TrkA domain-containing protein  30.13 
 
 		 636 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3620  sodium/hydrogen exchanger  27.96 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3180  TrkA domain-containing protein  32.55 
 
 		 838 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  27.59 
 
 		 637 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3867  sodium/hydrogen exchanger  25.88 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0872929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  24.74 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  23.61 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  23.06 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.89 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  22.81 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  21.84 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  21.84 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  21.84 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  21.84 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  21.84 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  21.84 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  21.84 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  26.35 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  23.04 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  23.29 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  23.3 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  23.3 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  24.51 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  23.34 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  22.14 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  24.49 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  22.67 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  22.52 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 		 586 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  23.61 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0270  sodium/hydrogen exchanger  27.49 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  22.6 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  24.78 
 
 		 586 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  22.34 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.43 
 
 		 587 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  25.58 
 
 		 587 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  23.45 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  24.65 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 		 667 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  20.99 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88925  Conserved hypothetical  29.38 
 
 		 469 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00702791  decreased coverage  0.00000780569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 		 592 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3224  sodium/hydrogen exchanger  24.49 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3111  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000824463  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  24.72 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.63 
 
 		 587 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  24.59 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  30.22 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  24.2 
 
 		 586 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  27.55 
 
 		 574 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.73 
 
 		 579 aa  54.3  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  25.49 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  25.76 
 
 		 741 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  24.13 
 
 		 585 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  24.07 
 
 		 585 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.41 
 
 		 575 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  23.46 
 
 		 649 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  23.66 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3068  potassium efflux system protein  25.84 
 
 		 631 aa  50.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  27.06 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  20.85 
 
 		 710 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  32.14 
 
 		 684 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.47 
 
 		 427 aa  50.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  23.95 
 
 		 424 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  38.71 
 
 		 602 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2355  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.8 
 
 		 602 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  26.28 
 
 		 624 aa  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  24.85 
 
 		 586 aa  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  25.52 
 
 		 657 aa  50.1  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4703  potassium efflux system protein  26.92 
 
 		 638 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829451  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3513  potassium efflux system protein  34.17 
 
 		 602 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0869039  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 		 574 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3414  sodium/hydrogen exchanger  34.65 
 
 		 605 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.399905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  22.29 
 
 		 741 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  24.08 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3094  sodium/hydrogen exchanger  34.65 
 
 		 605 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0617  sodium/hydrogen exchanger  28.77 
 
 		 571 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5246  potassium efflux system protein  30.92 
 
 		 595 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  23.46 
 
 		 663 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  33.8 
 
 		 585 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.93 
 
 		 720 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  31.18 
 
 		 757 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5156  potassium efflux system protein  30.92 
 
 		 595 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.458112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3169  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  24.19 
 
 		 567 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 		 469 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 		 576 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 		 585 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>