14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_88925 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009367  OSTLU_88925  Conserved hypothetical  100 
 
 		 469 aa  931    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00702791  decreased coverage  0.00000780569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4297  TrkA domain-containing protein  31.21 
 
 		 636 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3180  TrkA domain-containing protein  30.64 
 
 		 838 aa  97.4  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3867  sodium/hydrogen exchanger  27.99 
 
 		 429 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0872929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  29.06 
 
 		 637 aa  84.7  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  24.15 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  31.13 
 
 		 577 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  25.22 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1412  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.62 
 
 		 574 aa  55.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  23.53 
 
 		 399 aa  50.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  29.73 
 
 		 424 aa  43.5  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>