46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3224 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3224  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 417 aa  787    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.87 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  40.87 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  40.87 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  40.87 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  40.87 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  40.2 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  40.87 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  40.62 
 
 		 404 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.36 
 
 		 404 aa  253  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  40.71 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  42.12 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  40.87 
 
 		 404 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  40.87 
 
 		 404 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  42.13 
 
 		 400 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  40.1 
 
 		 404 aa  249  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  40.36 
 
 		 404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  40.1 
 
 		 404 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  41.09 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  37.59 
 
 		 418 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  36.75 
 
 		 406 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  36.66 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  36.16 
 
 		 407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  38.13 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3299  hypothetical protein  36.6 
 
 		 407 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3663  sodium/hydrogen exchanger  35.28 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0585  sodium/hydrogen exchanger  33.92 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270295  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  29.77 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  29.27 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0435  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0491  sodium/hydrogen exchanger  31.36 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0358  sodium/hydrogen exchanger  31.51 
 
 		 421 aa  142  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0719  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 		 420 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0347  sodium/hydrogen exchanger  31.27 
 
 		 421 aa  142  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0980496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4469  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.22757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  31.99 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  32.11 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  25.47 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.58 
 
 		 577 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  23.13 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  24.87 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  24.87 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1539  sodium/hydrogen exchanger  21.04 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0928193  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 665 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  23.44 
 
 		 392 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>