More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4196 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  77.6 
 
 		 574 aa  853    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  77.39 
 
 		 592 aa  877    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  76.74 
 
 		 576 aa  856    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  75.65 
 
 		 574 aa  855    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  77.45 
 
 		 581 aa  853    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  100 
 
 		 575 aa  1134    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  48.02 
 
 		 578 aa  476  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  47.24 
 
 		 571 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 		 565 aa  232  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 		 566 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  29.13 
 
 		 566 aa  227  4e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 566 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 		 595 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  29.5 
 
 		 558 aa  212  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  30.02 
 
 		 562 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  28.44 
 
 		 548 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 		 551 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  29.35 
 
 		 572 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 		 546 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 		 547 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 		 572 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 		 541 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  30.87 
 
 		 720 aa  196  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  31.62 
 
 		 561 aa  193  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  29.5 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 		 575 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 		 561 aa  190  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  33.78 
 
 		 424 aa  183  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  29.86 
 
 		 773 aa  183  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  27.26 
 
 		 741 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  30.56 
 
 		 566 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  30.07 
 
 		 771 aa  173  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  26.31 
 
 		 666 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  30.07 
 
 		 762 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  27.5 
 
 		 577 aa  168  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 		 674 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  25.84 
 
 		 682 aa  166  9e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  28.62 
 
 		 567 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  27.31 
 
 		 673 aa  165  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 		 775 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 		 666 aa  163  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  28.62 
 
 		 665 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  28.26 
 
 		 567 aa  161  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  28.62 
 
 		 665 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  26.2 
 
 		 650 aa  160  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  27 
 
 		 688 aa  160  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.36 
 
 		 567 aa  159  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  27.47 
 
 		 671 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.77 
 
 		 697 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  24.84 
 
 		 671 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 		 672 aa  159  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 		 659 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 		 693 aa  157  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 		 656 aa  156  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.81 
 
 		 663 aa  156  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 		 665 aa  156  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 		 585 aa  156  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  26.26 
 
 		 586 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  26.1 
 
 		 636 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  27.04 
 
 		 581 aa  153  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  26.52 
 
 		 556 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  26.84 
 
 		 575 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  30.48 
 
 		 659 aa  150  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  26.75 
 
 		 662 aa  150  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  26.62 
 
 		 664 aa  150  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  26.49 
 
 		 658 aa  150  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  26.47 
 
 		 584 aa  150  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 		 659 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  23.88 
 
 		 658 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  27.22 
 
 		 649 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  28.14 
 
 		 648 aa  147  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 584 aa  147  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  26.05 
 
 		 665 aa  147  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 		 666 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3563  putative potassium efflux transporter (ybaL)  26.55 
 
 		 585 aa  146  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  26.71 
 
 		 584 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  26.25 
 
 		 666 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  27.09 
 
 		 668 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0814  sodium/hydrogen exchanger  26.89 
 
 		 577 aa  145  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0542248  normal  0.0778993 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 		 457 aa  145  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  27.53 
 
 		 555 aa  144  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 		 653 aa  144  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1573  potassium efflux system protein  27.18 
 
 		 574 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566024  hitchhiker  0.00174372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 		 674 aa  143  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  25.09 
 
 		 542 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 		 598 aa  141  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  27.96 
 
 		 667 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2222  hypothetical protein  83.75 
 
 		 83 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0138453  normal  0.531895 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  26.86 
 
 		 584 aa  140  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  25.23 
 
 		 582 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  27.07 
 
 		 573 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  28.32 
 
 		 659 aa  139  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.65 
 
 		 620 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.24 
 
 		 620 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  26.27 
 
 		 577 aa  138  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.57 
 
 		 620 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.57 
 
 		 620 aa  137  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.57 
 
 		 620 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  28.57 
 
 		 620 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>