More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2284 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  74.49 
 
 		 541 aa  792    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  70.71 
 
 		 572 aa  716    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 572 aa  1120    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  59.16 
 
 		 575 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  55.94 
 
 		 562 aa  565  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  55.83 
 
 		 566 aa  558  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  56.2 
 
 		 561 aa  554  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  54.04 
 
 		 558 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  54 
 
 		 561 aa  504  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  48.62 
 
 		 595 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  48.72 
 
 		 546 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  48.5 
 
 		 551 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  62.47 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  43.35 
 
 		 548 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  46.63 
 
 		 547 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  46.45 
 
 		 547 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  46.29 
 
 		 720 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  38.82 
 
 		 566 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  38.21 
 
 		 566 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  40.58 
 
 		 565 aa  365  2e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  44.82 
 
 		 566 aa  356  6.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  37.86 
 
 		 566 aa  346  8e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 		 578 aa  219  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28 
 
 		 575 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  31.17 
 
 		 571 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 592 aa  210  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  31.23 
 
 		 577 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  29.13 
 
 		 574 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  29.69 
 
 		 576 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  28.31 
 
 		 574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  28.36 
 
 		 581 aa  190  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  28.44 
 
 		 682 aa  188  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  29.18 
 
 		 624 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  27.05 
 
 		 648 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  26.38 
 
 		 775 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  26.22 
 
 		 649 aa  171  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.11 
 
 		 671 aa  170  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  25.93 
 
 		 648 aa  167  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  25.83 
 
 		 648 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  25.83 
 
 		 648 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 		 664 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  26.08 
 
 		 648 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  25.86 
 
 		 584 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  28.06 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  26.27 
 
 		 649 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  24.72 
 
 		 649 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  25.1 
 
 		 648 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  25.1 
 
 		 648 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  25.1 
 
 		 648 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 		 598 aa  162  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 		 674 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  25.72 
 
 		 653 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  25.31 
 
 		 648 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  25.97 
 
 		 636 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  25.4 
 
 		 650 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  23.41 
 
 		 650 aa  157  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  26.15 
 
 		 562 aa  156  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.8 
 
 		 663 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.55 
 
 		 720 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  27.02 
 
 		 673 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  25.74 
 
 		 563 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  27.5 
 
 		 658 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 		 598 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  27.18 
 
 		 662 aa  154  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.26 
 
 		 553 aa  154  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  26.27 
 
 		 631 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  25.55 
 
 		 563 aa  153  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  24.95 
 
 		 567 aa  153  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  25.1 
 
 		 561 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  27.54 
 
 		 582 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.18 
 
 		 567 aa  152  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  24.77 
 
 		 567 aa  152  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  24.9 
 
 		 561 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.49 
 
 		 524 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  25.15 
 
 		 658 aa  151  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 		 656 aa  151  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  26.34 
 
 		 671 aa  151  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 		 585 aa  150  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  26.28 
 
 		 563 aa  150  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.68 
 
 		 697 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  26.62 
 
 		 665 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  24.65 
 
 		 656 aa  148  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  26.15 
 
 		 660 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  25.1 
 
 		 660 aa  147  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 		 666 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 		 666 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  24.91 
 
 		 773 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  25.05 
 
 		 654 aa  146  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  26.62 
 
 		 661 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  26.16 
 
 		 584 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  27.24 
 
 		 666 aa  145  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  25.99 
 
 		 762 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  26.62 
 
 		 661 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  23.88 
 
 		 649 aa  144  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  25.8 
 
 		 741 aa  143  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.16 
 
 		 617 aa  143  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 		 520 aa  143  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  26.23 
 
 		 657 aa  143  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  25.05 
 
 		 576 aa  143  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  23.78 
 
 		 664 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>