More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3552 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
551 aa  1089    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  66.98 
 
 
595 aa  696    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  53.59 
 
 
558 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  58.24 
 
 
546 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  53.42 
 
 
575 aa  507  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  51.54 
 
 
562 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  50.27 
 
 
561 aa  485  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  52.11 
 
 
561 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  48.72 
 
 
566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  50.55 
 
 
572 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  47.75 
 
 
541 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  48.01 
 
 
572 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  44.49 
 
 
548 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  46.85 
 
 
547 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  46.85 
 
 
547 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  47.84 
 
 
566 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  46.38 
 
 
720 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  58.51 
 
 
424 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  36.57 
 
 
565 aa  353  4e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  36.4 
 
 
566 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  36.2 
 
 
566 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  36 
 
 
566 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  31.65 
 
 
576 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  32.53 
 
 
571 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 
574 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  30.8 
 
 
592 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 
577 aa  216  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.11 
 
 
575 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  30.38 
 
 
574 aa  206  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  31.09 
 
 
581 aa  199  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  31.49 
 
 
578 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  28.51 
 
 
674 aa  187  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 
584 aa  187  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  27.41 
 
 
567 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.1 
 
 
567 aa  182  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 
771 aa  181  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  27.82 
 
 
650 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  26.95 
 
 
567 aa  180  8e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  25.81 
 
 
648 aa  179  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  25.19 
 
 
648 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  24.9 
 
 
649 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  25 
 
 
648 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  24.95 
 
 
649 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  25 
 
 
648 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  27.26 
 
 
741 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  27.77 
 
 
775 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  25 
 
 
648 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  25.24 
 
 
648 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  23.5 
 
 
650 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  25 
 
 
648 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  25 
 
 
648 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  28.38 
 
 
562 aa  174  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  27.97 
 
 
563 aa  173  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  28.26 
 
 
773 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  25 
 
 
648 aa  172  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  28.04 
 
 
673 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  28.04 
 
 
682 aa  170  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  27.25 
 
 
562 aa  170  8e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  25.79 
 
 
653 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  23.97 
 
 
649 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  27.41 
 
 
563 aa  169  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  28.01 
 
 
667 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.94 
 
 
720 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  26.53 
 
 
583 aa  166  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 
598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  27.2 
 
 
563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 
666 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.97 
 
 
663 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  26.97 
 
 
561 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 
762 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.2 
 
 
697 aa  163  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  27.48 
 
 
671 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  25.95 
 
 
565 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  24.46 
 
 
649 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  27.81 
 
 
656 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  26.93 
 
 
624 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 
666 aa  161  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 
674 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  26.18 
 
 
561 aa  161  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  25.99 
 
 
657 aa  161  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  28.46 
 
 
567 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 
660 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0190  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 
562 aa  161  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  28.43 
 
 
568 aa  161  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 
457 aa  160  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  25.28 
 
 
564 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  29.81 
 
 
668 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  26.1 
 
 
662 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 
666 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.07 
 
 
524 aa  159  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  26.64 
 
 
665 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  26.64 
 
 
665 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  27.34 
 
 
556 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 
661 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  27.14 
 
 
661 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 
672 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  26.8 
 
 
555 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  27.44 
 
 
660 aa  157  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 
659 aa  157  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  26.09 
 
 
575 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.769555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>