More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0193 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
598 aa  1175    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  47.69 
 
 
577 aa  497  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  41.95 
 
 
584 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  39.72 
 
 
624 aa  351  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  29.01 
 
 
566 aa  236  6e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  28.63 
 
 
566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 
565 aa  225  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  28.63 
 
 
566 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 
558 aa  211  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 
762 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  28.89 
 
 
595 aa  194  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 
541 aa  191  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  29.04 
 
 
773 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  29.32 
 
 
546 aa  189  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  29.98 
 
 
720 aa  188  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  27.55 
 
 
775 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  31 
 
 
572 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  27.33 
 
 
771 aa  180  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 
576 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  27.66 
 
 
649 aa  180  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  27.47 
 
 
665 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  27.47 
 
 
665 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 
551 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 
574 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  29.45 
 
 
578 aa  176  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  29.54 
 
 
575 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 
572 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  26.59 
 
 
649 aa  171  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  28.99 
 
 
574 aa  171  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 
592 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  29.04 
 
 
571 aa  166  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  26.44 
 
 
562 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  26.84 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  27.06 
 
 
653 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  28.46 
 
 
648 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  27.44 
 
 
664 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 
666 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  26.25 
 
 
649 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.29 
 
 
575 aa  164  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  26.93 
 
 
561 aa  160  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  26.55 
 
 
566 aa  160  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  30.67 
 
 
566 aa  160  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  26.86 
 
 
649 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  26.4 
 
 
650 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  27.39 
 
 
648 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.41 
 
 
648 aa  157  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  28.82 
 
 
547 aa  157  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  28.82 
 
 
547 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  26.14 
 
 
662 aa  156  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  28.33 
 
 
581 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  27.2 
 
 
648 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  27.18 
 
 
648 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  27.18 
 
 
648 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  27.2 
 
 
648 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 
673 aa  153  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.31 
 
 
648 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 
667 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  27.33 
 
 
665 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  27.99 
 
 
583 aa  150  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  27.66 
 
 
674 aa  150  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  27.2 
 
 
648 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
657 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 
656 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 
666 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  24.9 
 
 
658 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  26.89 
 
 
671 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  25.77 
 
 
682 aa  143  7e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  25.64 
 
 
567 aa  144  7e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  32.7 
 
 
424 aa  143  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  23.26 
 
 
741 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  25.46 
 
 
650 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  25.36 
 
 
567 aa  143  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 
666 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2112  potassium efflux system protein  28.83 
 
 
624 aa  142  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521521  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 
561 aa  141  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  24.85 
 
 
671 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.42 
 
 
663 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 
665 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.18 
 
 
567 aa  139  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.75 
 
 
720 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 
654 aa  137  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.82 
 
 
670 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  26 
 
 
562 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  24.6 
 
 
624 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0904  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  24.12 
 
 
608 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  24.76 
 
 
636 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  25.61 
 
 
584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.68 
 
 
588 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  25.97 
 
 
684 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 
598 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  23.84 
 
 
564 aa  134  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 
662 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.81 
 
 
579 aa  131  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 
586 aa  132  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  24.42 
 
 
666 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  24.5 
 
 
658 aa  130  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 
567 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  26.42 
 
 
555 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  27.13 
 
 
577 aa  130  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3169  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 
567 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>