More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0751 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  87.95 
 
 		 574 aa  981    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  79.73 
 
 		 592 aa  908    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  77.97 
 
 		 575 aa  885    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  79.17 
 
 		 574 aa  899    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 581 aa  1146    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  79.17 
 
 		 576 aa  877    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  48.72 
 
 		 571 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  47.87 
 
 		 578 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 		 565 aa  223  8e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 		 566 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 566 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 		 566 aa  213  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 		 595 aa  197  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  31.46 
 
 		 551 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  29.84 
 
 		 541 aa  194  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  30.85 
 
 		 547 aa  193  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  30.85 
 
 		 547 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  30.43 
 
 		 720 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 		 572 aa  187  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 		 548 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  30.67 
 
 		 546 aa  186  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  29.41 
 
 		 572 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  30.04 
 
 		 575 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 		 688 aa  181  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  28.65 
 
 		 558 aa  181  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 		 561 aa  180  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  28.65 
 
 		 562 aa  176  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  26.97 
 
 		 656 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  26.05 
 
 		 741 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  32.96 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  28.8 
 
 		 773 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  28.49 
 
 		 566 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  26.91 
 
 		 665 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  26.91 
 
 		 665 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  28.02 
 
 		 561 aa  162  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.11 
 
 		 663 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 		 566 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 		 666 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  27.9 
 
 		 762 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 775 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  27.07 
 
 		 674 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  26.91 
 
 		 586 aa  157  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 		 771 aa  157  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  25.76 
 
 		 682 aa  157  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  26.42 
 
 		 584 aa  154  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 		 673 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  24.77 
 
 		 672 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  27.07 
 
 		 577 aa  153  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 		 668 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  25.18 
 
 		 666 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  25.46 
 
 		 665 aa  151  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.55 
 
 		 697 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  27.37 
 
 		 582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 		 567 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 		 584 aa  148  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.28 
 
 		 671 aa  148  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 		 671 aa  147  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.3 
 
 		 567 aa  147  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  25.05 
 
 		 650 aa  146  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  27.6 
 
 		 567 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  24.21 
 
 		 636 aa  143  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  27.07 
 
 		 585 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  28.82 
 
 		 667 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  25.49 
 
 		 664 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  27.41 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 659 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 		 693 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  24.44 
 
 		 666 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  26.55 
 
 		 670 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.8 
 
 		 588 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  28.03 
 
 		 649 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  29.6 
 
 		 659 aa  140  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2222  hypothetical protein  84.34 
 
 		 83 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0138453  normal  0.531895 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 		 666 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  26.56 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.1 
 
 		 648 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  26.72 
 
 		 649 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  33.15 
 
 		 598 aa  137  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  30.17 
 
 		 620 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  26.44 
 
 		 648 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  25.99 
 
 		 581 aa  136  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 		 653 aa  136  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.58 
 
 		 621 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  24.8 
 
 		 658 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 		 660 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  31.89 
 
 		 662 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  26.15 
 
 		 575 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1573  potassium efflux system protein  27.58 
 
 		 574 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566024  hitchhiker  0.00174372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 		 665 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  30.84 
 
 		 662 aa  133  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  27.09 
 
 		 584 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 		 584 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  27.92 
 
 		 649 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  29.33 
 
 		 659 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  25.7 
 
 		 674 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.79 
 
 		 620 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  26.67 
 
 		 649 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.79 
 
 		 620 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  25.54 
 
 		 555 aa  131  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.79 
 
 		 620 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>