More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3972 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
424 aa  822    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  76.76 
 
 
562 aa  540  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  73.11 
 
 
561 aa  510  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  72.32 
 
 
566 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  72.04 
 
 
575 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  65.35 
 
 
572 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  60.24 
 
 
541 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  62.14 
 
 
558 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  62.01 
 
 
572 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  57.29 
 
 
595 aa  415  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  59.79 
 
 
551 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  62.73 
 
 
561 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  58.38 
 
 
546 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  50.93 
 
 
548 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  54.34 
 
 
720 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  49.75 
 
 
547 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  49.75 
 
 
547 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  42.74 
 
 
566 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  42.47 
 
 
566 aa  302  1e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  52.96 
 
 
566 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  41.64 
 
 
565 aa  292  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  42.61 
 
 
566 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.69 
 
 
575 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  34.22 
 
 
576 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 
571 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  33.24 
 
 
592 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  33.69 
 
 
574 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  34.68 
 
 
577 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  32.58 
 
 
574 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 
581 aa  170  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  32.16 
 
 
578 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  30.87 
 
 
674 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  31.17 
 
 
662 aa  147  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  31.27 
 
 
741 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 
664 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.68 
 
 
567 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  29.43 
 
 
775 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  30.97 
 
 
584 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.66 
 
 
697 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1464  hypothetical protein  29.84 
 
 
390 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1519  hypothetical protein  29.84 
 
 
390 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  30 
 
 
650 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 
567 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 
567 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  31.83 
 
 
682 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2015  sodium/hydrogen antiporter  30.89 
 
 
388 aa  136  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00713619  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2348  sodium/hydrogen exchanger  30.27 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0304775 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0567  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.81 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358898  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1616  potassium/proton antiporter  30.81 
 
 
406 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  30.36 
 
 
656 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 
658 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 
585 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  32.97 
 
 
598 aa  133  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  31.88 
 
 
673 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.15 
 
 
648 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.63 
 
 
585 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  28.97 
 
 
648 aa  131  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  30.56 
 
 
584 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.05 
 
 
720 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  31.04 
 
 
606 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 
666 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 
636 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 
585 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 
606 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  32.14 
 
 
556 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  28.41 
 
 
762 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.3 
 
 
671 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  27.3 
 
 
648 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  27.3 
 
 
648 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 
671 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 
672 aa  126  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  27.4 
 
 
624 aa  126  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  26.21 
 
 
648 aa  126  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  26.21 
 
 
648 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  26.21 
 
 
648 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  26.53 
 
 
649 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.97 
 
 
587 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  26.76 
 
 
649 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.08 
 
 
648 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  29.01 
 
 
773 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 
665 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 
665 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  25.93 
 
 
648 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  29.12 
 
 
563 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 
586 aa  123  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0766  sodium/hydrogen exchanger  33.6 
 
 
387 aa  123  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  28.97 
 
 
561 aa  122  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 
666 aa  122  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.16 
 
 
587 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.27 
 
 
663 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  30.58 
 
 
575 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  30.05 
 
 
583 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 
565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  29.38 
 
 
670 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  28.73 
 
 
562 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  27.95 
 
 
654 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  28.69 
 
 
561 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  30.94 
 
 
661 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  32.49 
 
 
668 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>